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5 hmmsearch新建HMM模型之后再次搜索出现报错，请问老师什么原因

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5 各位老师好，我买了你家的基因家族的课程，我咨询一下几个问题：（1）我分析NBS-LRR基因家族，其中CC结构域没有hmm文件，你们分享的文献中说用Paircoin2软件，我想问一下，这个软件怎么使用；（2）我用figtree美化进化树，为什么树枝上的Bootstrp是小数，而不是MEGA建树中的整数。

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5 进化树构建出问题

  • 2020-11-03 00:54
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5 请问老师基因家族分析这一步出现错误怎么解决，谢谢

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5 请问我的circose作图没有灰色部分？确认是按视频说的做的，哪里出了问题呢？

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20 用iTOL美化进化树时出现如下问题，求解答。

  • dec. 2020-10-27 11:57
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15 基因家族分析有没有推荐的审稿人？

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5 两个基因是片段重复基因对，序列完全一致，但是KA/KS值为NA

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3 按照视频上操作的，为什么这个会报错，不能运行啊

  • 2020-10-13 11:09
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8 KA/KS计算得到的串联重复基因对与Circos图不一致

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5 用hmmer search搜索基因家族的时候，怎么也找不到结构域。怎么办，序列和代码都是对的。

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5 单个物种的单个基因的kaks怎么计算

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10 figtree 标签复制入表格顺序发生错乱

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10 如何将hmmer search到的某一基因家族成员序列拼接成一条完整的序列

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6 基因家族分析 处理GFF 文件里面ID不对应，该怎么处理

  • Leo 2020-08-21 16:34
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5 提取保守结构域

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5 blast建库比对

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10 MCScanX制作pep.fa出现错误，请问怎么解决

  • 2020-07-22 19:09
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5 进行基因家族成员鉴定的时候，是不是在hmmsearch搜索后，只要用CDD或Pfam鉴定出含有该基因家族的保守结构域，就可以认为该基因属于这个家族吗？

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5 我想问一下，对于MADS-box这种辅助域的Pfam号和DNA-binding的Pfam号不同的基因家族，做成员鉴定的时候，需要下2个种子序列不？