GEO单细胞转录组数据挖掘示例代码汇总

单细胞数据挖掘示例代码
GEO中单细胞转录组数据不同数据类型可以用不同参数读入:




IF=5.6|GBM单细胞数据挖掘实践:https://www.omicsclass.com/article/1673

IF=6.68| HCC肝癌单细胞数据挖掘实践: https://www.omicsclass.com/article/1677 

BCC 基底细胞癌(GSE123813 count表格输入):https://www.omicsclass.com/article/2483 


BLCA膀胱癌(GSE192575 多样本10X):https://www.omicsclass.com/article/2498


BRCA乳腺癌(E-MTAB-8107 rds文件输入): https://www.omicsclass.com/article/2499

BRCA乳腺癌(GSE161529 多样本10X):https://www.omicsclass.com/article/2500

UM葡萄膜黑色素瘤(GSE139829 多样本10X):https://www.omicsclass.com/article/2512 


肝细胞癌(HCC)(GSE149614 count表格输入):https://www.omicsclass.com/article/2513


非小細胞肺癌(NSCLC)(GSE127465 indrop数据) : https://www.omicsclass.com/article/2515


非小细胞肺癌 (GSE139555 10X 多样本批量):https://www.omicsclass.com/article/2532

结直肠癌 CRC(GSE146771 smart-seq2数据):https://www.omicsclass.com/article/2516


结直肠癌 CRC(GSE178341 h5数据输入):https://www.omicsclass.com/article/2518


头颈癌(HNSCC)(GSE181919 count表格输入):https://www.omicsclass.com/article/2567 


代码在单细胞转录组分析课程:https://bdtcd.xetslk.com/s/4i88K6


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  • 发表于 2024-06-11 17:18
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  • 分类:转录组

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