hisat2

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老师，你好。在做有参转录组分析，准备的文件有基因组注释文件gtf,cds,pep(其中cds,pep都是fasta格式的序列文件），命令如下。其中第一个截图是参考pep文件，比对率为0，；第二个结果是参考cds文件，比对率为57.81%，比较低，这是哪里出了问题吗。另外所以准备的文件应该是cds文件而不是pep文件是吗

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用 hisat2 建索引时出现 “is not reverse-deterministic, so reverse-determinize...”

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Hisat2-building建立index中的killed问题

  • LCJ 2019-02-10 18:29:11

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