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192 个回答

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转录组kegg富集,deg emsembl id不存在

物种表格包含你分析的物种吗? 可以使用eggnog数据库注释

回答于 6天前

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泛基因家族分析做PVA绘图时,总共20个样本,每次绘图后就剩19个

可以吧运行命令截图一下,有报错吗

回答于 2026-01-29 21:36

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老师下面这个问题怎么解决呀,我换一个物种他就可以完成,

运行报错了,检查一下输入ID列表文件,或直接去fa文件中根据ID搜索基因是否存在,注意文件编码系统:https://www.omicsclass.com/article/1727

回答于 2026-01-26 10:17

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hmmsearch运行时异常终止

检查一下输入文件的格式或内容是否正确,可以参考示例数据的文件格式。

回答于 2026-01-12 18:00

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泛基因家族分析,核心基因等数量统计

课程中存在缺失分析中用到的泛基因数据集,是通过基因序列相似性和共线性区域关联 得到的。

回答于 2026-01-04 16:44

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泛基因家族做完PAV分析后,发现有的物种没有任何一个基因

先检查一下绘图的输入文件中这些品系是否数据正常。输入文件中这些品系在那些家族基因中有同源基因

回答于 2025-12-27 21:21

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SV与家族基因的保守结构域分析

有可能结构变异未影响基因的保守结构域。也可以做一下其它比较多变异数据的基因组的保守结构域分析。可以定位到基因组具体发生结构变异的家族成员序列上,看基因序列与未变异的基因序列之间的差异

回答于 2025-12-03 17:25

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关于保守结构域选择几个的问题

这个要先确认基因家族的结构域特点,可以看相关文献中鉴定结果的筛选标准。

回答于 2025-11-20 17:59

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泛基因家族分析之基因家族成员选择压力分析

镜像和脚本是配套的,不用在容器里面更改R包。可以检查一下镜像和脚本,重新开一个容器运行尝试一

回答于 2025-11-16 08:47

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泛基因家族-进化树

仔细观察进化树,其实WRKY49是进化支最外侧的分支。加上WRKY12,这种情况会默认范围会包含里侧全部分支。针对这种分支,可以设置WRKY12~WRKY86一组,WRKY49单独一组,其它颜色参数一致就行

回答于 2025-10-31 16:48