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48 个回答

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第一张图片为smart,没有查询到结构域。第二张图片为interpro,...

SMART、CDD、InterPro三个数据库的结果取并集

回答于 1天前

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做基因家族,需要下载图片中哪些文件?Genome Gff CDS Protein d...

用课程的脚本,只需要下载genome染色体序列文件和GFF注释文件就行

回答于 2025-01-22 09:32

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基因家族分析中的顺势作用元件分析问题

正链负链都算预测得到的结果

回答于 2025-01-14 09:52

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在基因家族分析中的顺势作用元件分析中有几个差不多的元件是不是...

看一下3个元件具体的碱基序列,以及在启动子序列上的位置一不一样

回答于 2025-01-13 10:25

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putty下载基因组数据太慢

可以直接下载到本地。然后使用Filezilla上传到服务器上

回答于 2024-12-26 17:39

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在进行转录组分析时,在自己的服务器上怎么使用以下命令,请老师...

这两个脚本没有在scripts文件夹下的话,就是打包到了docker镜像里了。可以通过在镜像里面提取这个脚本,然后复制到自己服务器上去使用。不过有些软件脚本写的复杂,不是简单复制即可运行,复杂的软件会有很多依赖简单复制不一定能运行,需要按要求安装软件才能正常运行。比如安装 AGAT这个软件;不会安装直接使用我们的云服...

回答于 2024-12-24 11:10

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基因家族一个基因的两个结构域序列重叠

是数据库网站二次确认显示两个结构域是残基并且相互重叠?可以参考这个基因家族的相关文献。如果是结构域残基就需要舍弃这个结果

回答于 2024-12-23 17:40

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基因家族两个结构域

具体的基因家族可以去搜索相关文献,看其它文章是怎么鉴定这个基因家族成员的,看两个结构域分别hmmsearch之后应该取交集还是并集。最终确定基因家族成员之后,再去提取结构域序列、蛋白全长序列进行后续分析。

回答于 2024-12-23 17:32

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基因家族分析时,提取cds与pep序列报错显示 no sequence

看一下数据文件,是不是染色体序列文件里没有Scaffold1序列,gff文件里有Scaffold1序列的注释信息,导致报错

回答于 2024-12-19 10:46

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命令行复制

在putty中,复制命令可以通过双击想复制的字符串或者拖动光标选中想复制的字符串,必须选中才算复制上。粘贴命令通过单击鼠标右键,可以将内容粘贴到绿色插入点处。 复制失败是不是没有选中复制成功,或者本地开着“划译”功能的软件例如百度翻译

回答于 2024-12-17 17:47