有可能结构变异未影响基因的保守结构域。也可以做一下其它比较多变异数据的基因组的保守结构域分析。可以定位到基因组具体发生结构变异的家族成员序列上,看基因序列与未变异的基因序列之间的差异
回答于 2025-12-03 17:25
仔细观察进化树,其实WRKY49是进化支最外侧的分支。加上WRKY12,这种情况会默认范围会包含里侧全部分支。针对这种分支,可以设置WRKY12~WRKY86一组,WRKY49单独一组,其它颜色参数一致就行
回答于 2025-10-31 16:48
gff文件中缺少基因gene注释信息行,导致gtf文件不标准,出现报错KeyError: 'gene_id',使得后续无法获取gene_length.txt文件。可以重新找一个存在gene注释信息的基因组。也可以人为添加上相关信息,参考笔记:https://www.omicsclass.com/article/2081
回答于 2025-10-30 10:52