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选择非冗余基因模板的自比对，pangene与pangene两个文件进行共线...
可以，确认进程完全停止后，删除所有中间文件，再加入参数--cpus 1 --batch 1000，去运行。随时通过“ps -xf”监控后台进程
回答于 4天前
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选择非冗余基因模板的自比对，pangene与pangene两个文件进行共线...
看看生成的中间文件大小有没有增长，或者通过“ps -xf”命令查看进程的状态，参考笔记：https://www.omicsclass.com/article/483如果是终止状态的话只能杀死进程重新运行：先删除中间文件，再修改参数--cpus 1，--batch 1000 ，或者先用小数据测试一下。
回答于 5天前
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各位老师好，请问我研究的是玉米泛基因家族，学习了泛基因的课程...
不是所有的基因家族都存在非常保守的结构域和由结构域构建的HMM模型。这种情况可以不选择hmmer鉴定，只选择blast鉴定的方法。具体可以借鉴该基因家族已发表的相关文献
回答于 2026-04-21 10:11
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