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老师，我做泛基因家族鉴定时，06.SV_analysis最后得到的All.fina...
1.确认输入all_merge.vcf文件是否是结构变异文件2. 与demo示例数据为参考，确认中间文件格式正确，注意文件格式问题，https://www.omicsclass.com/question/8061/answer/73563. 手动确认泛基因的变异信息，如果同物种的话，变异信息少。也可能结果就一条
回答于 2025-08-12 10:03
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基因家族分析
根据提取的脚本，基因需要提供正负链信息，提取负链基因的启动子序列后需要反向互补，正链基因则不需要。基于此，最终得到的启动子序列都是B端靠近基因ATG的。
回答于 2025-08-04 16:58
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泛基因家族分析
先手动检查一下apple.WRKYgene.list中的基因ID是不是全部在15apple.pan-genes.list文件中出现，能被搜索到，是不是文件内容或者格式有问题，
回答于 2025-08-01 15:10
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