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31 个回答

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安装本地docker出现错误

首先确认docker 是否安装并打开。在 当前命令行界面 中运行 docker version 命令,是否能正确输出docker 版本信息。具体安装操作可以参考:https://www.omicsclass.com/article/1198。 正确打开之后再去安装基因家族分析镜像

回答于 3天前

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成功得到了gvcf文件后,合并gvcf文件时,在导入db步骤中,由于gv...

使用GATKA中的 IndexFeatureFile 工具来构建索引。gatk --java-options "-Xmx50g"  IndexFeatureFile -I  **.g.vcf.gz

回答于 2024-10-18 11:27

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mcsanx作图问题

染色体的黑色边框?绘图软件没有选项参数修改。可以用ai手动修改,将黑色填充成其它颜色

回答于 2024-10-11 11:02

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基因组间共线性分析作图问题

最简单的就是在Adobe Illustrator软件中手动对染色体label进行修改,染色体名称很长可以使用缩写、重命名或者把label竖着写。 也可以在绘图时对mcscan_layout和mcscan_seqid配置文件中,所有用到的绘图文件的染色体label,全部重命名。

回答于 2024-10-11 09:37

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在共线性分析中发现结果太少

cscore值调低一点

回答于 2024-09-24 11:00

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MCScanX这一步做完分析后发现了问题

WRKY.tandem文件是从第八步复制过来的。如果本身是空的证明该基因家族没有串联重复基因对。 另一个文件是那一步的?可能是本身没有结果

回答于 2024-09-23 15:30

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TBtools报错

如果想对基因ID进行重命名。需要将基因结构图用到的所有文件的基因ID进行修改。检查一下所有输入文件有没有修改,对应上。

回答于 2024-09-12 17:05

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进化树想修改一下分支

想调整A\B枝的位置,单击分支处,在弹出面板上选择“Rotate children”即可

回答于 2024-09-12 11:10

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GSDS展示图中想修改下基因名称

修改gff文件,或者在Ai中修改图片,都可以修改了基因名称

回答于 2024-09-12 11:00

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关于代谢组学的原始文件处理

课程是从代谢物表达量开始分析的。原始数据.raw需要经过搜库分析,可以根据质谱仪选择合适的搜库软件去进行搜库分析,才能得到表达量矩阵文件。

回答于 2024-09-12 09:41