rzx
rzx

性别: 注册于 2021-03-22

向TA求助
1200金币数
10180 经验值
10个粉丝
主页被访问 23521 次

208 个回答

0 赞同

如何安装运行syri

泛基因家族镜像中有syri。/share/work/biosoft/python/Python3/bin/syri

回答于 2026-07-02 13:04

0 赞同

泛基因家族分析结构变异分析,生成的mcoords和mdelta文件为空

你单独运行一个品系,看有没有报错

回答于 2026-07-02 10:39

0 赞同

泛基因家族分析perl

可以去看一下对应分析的perl脚本里面用到了什么模块

回答于 2026-06-29 18:17

0 赞同

1、使用筛选出来的基因家族的CDS序列,使用NCBI设计引物,选择pr...

CDS序列设计引物就不要勾选跨外显子接头选项。如果想引物再核酸保守区,可以挑选保守区来设计引物,同时设计完成后通过 BLAST 验证引物保守性

回答于 2026-06-15 13:37

0 赞同

筛选出来的基因家族成员,后续要进行qPCR,是根据基因家族成员的...

是根据cds设计引物,cds长度>70就不算太短

回答于 2026-06-09 17:33

0 赞同

选择非冗余基因模板的自比对,pangene与pangene两个文件进行共线...

可以,确认进程完全停止后,删除所有中间文件,再加入参数--cpus 1 --batch 1000,去运行。随时通过“ps -xf”监控后台进程

回答于 2026-06-09 15:12

0 赞同

选择非冗余基因模板的自比对,pangene与pangene两个文件进行共线...

看看生成的中间文件大小有没有增长,或者通过“ps -xf”命令查看进程的状态,参考笔记:https://www.omicsclass.com/article/483如果是终止状态的话只能杀死进程重新运行:先删除中间文件,再修改参数--cpus 1,--batch 1000 ,或者先用小数据测试一下。

回答于 2026-06-09 09:27

0 赞同

对gff文件进行处理,保留注释信息中能编码蛋白的基因。得到的结...

检查一下gff文件的格式是否标准,是不是9列。截图是格式有问题

回答于 2026-04-30 21:51

0 赞同

对每一个gff文件进行处理,保留蛋白编码基因

检查一下输入文件是否存在

回答于 2026-04-27 13:15

0 赞同

将基因组序列文件和注释文件批量链接到当前文件夹 对每一个gff文...

't' 的符号要用英文单引号

回答于 2026-04-27 10:14