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192 个回答

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老师,我要分析几个品种的基因表达量数据,在公共数据库大部分只...

是的,不同品系间的基因表达量分析,最好选取同一处理下相同组织的样本。2. 如果想用一个品种作物参考基因组去定性定量其它品种的rnaseq数据,要先确认品种间亲缘关系近,参考基因注释好,如果其它品种的reads比对到参考基因组上的map比对率过低的话,就要慎重考虑最终定量结果可靠性

回答于 2025-09-08 11:18

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老师,我做基因家族基因结构变异信息时,只有8条结果,这个结果...

物种不同品系间结构变异数量不多是正常的,有变异结果就可以接着往下做

回答于 2025-08-28 10:46

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HISAT2比对时报错|sam文件为空白,summary文件为(ERR): hisat2-a...

可用存储挺多的,但HISAT2比对过程对内存需求较高,也跟物种索引文件大小有关。可以在运行任务时通过top命令实时监控"%MEM"(进程内存占用占系统总内存的百分比)。

回答于 2025-08-27 15:33

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基因家族数据准备#提取cds序列#提取pep序列

看基因组挺大的,放后台过几十分钟再看看。

回答于 2025-08-17 20:19

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老师,我做泛基因家族鉴定时,06.SV_analysis最后得到的All.fina...

1.确认输入all_merge.vcf文件是否是结构变异文件2. 与demo示例数据为参考,确认中间文件格式正确,注意文件格式问题,https://www.omicsclass.com/question/8061/answer/73563. 手动确认泛基因的变异信息,如果同物种的话,变异信息少。也可能结果就一条

回答于 2025-08-12 10:03

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泛基因家族分析绘制kaks>1频率分布的热图

可以 手动修改kaks_greater_than_1_gene_rate.txt,将想删除的成员删除

回答于 2025-08-06 09:19

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泛基因家族分析核心基因的确定

根据核心基因的定义确定

回答于 2025-08-06 09:14

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为什么启动镜像时总是出现这样的报错啊老师

路径写错了。看报错提示,路径demo少写了个“o”

回答于 2025-08-06 09:09

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泛基因家族分析进化树构建

进化树上默认显示的就是输入序列ID,最简单的方法是改动序列ID,也可以在后续美化时用美化软件修改分支标签

回答于 2025-08-05 09:24

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泛基因家族分析

进化树分析中是提取第一条序列作为泛基因序列进行进化树分析。课程里面也不都是同一品种的

回答于 2025-08-05 09:16