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circos绘图
如果有基因对信息的话，最好还是绘制出来。 关于scaffold序列长度信息，通过代码“ ## 获得染色体长度 seqkit fx2tab --length --name ../01.data_prepare/Arabidopsis_thaliana.TAIR10.dna.toplevel.fa.gz|awk '{print $1,$NF}' >genome.len ” 是可以得到的，如果scaffold序列是在Arabidopsis_thaliana.TAIR10.dna...
回答于 2025-06-05 16:53
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为挂载到染色体上的基因家族成员能否绘制基因在染色体上的定位图...
这个基因没有在染色体上的位置信息，只有在scaffold上有位置信息。如果想展示这个基因的话，只能将该scaffold也跟染色体一样去准备长度信息。在结果图中，将scaffold及在scaffold上的基因信息绘制出来。
回答于 2025-06-03 16:10
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RNA-SEQ分析中，基因ID位于Chr01-Chr09的基因的reads数目全部是0
正确的测序应该是有比对结果的。先根据流程看上一步生成的结果有没有问题，运行脚本时看有没有报错日志。看看map结果中每个样本的比对率（*summary文件）是否正常，正常结果中有90%以上的reads会比对到基因上
回答于 2025-06-03 11:43
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进化树+motif+基因结构三个一起显示报错
具体绘图可以参考操作笔记：https://www.omicsclass.com/article/1269 如果报错的话可以把报错发出来看一下
回答于 2025-06-03 09:15
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