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蛋白3D结构预测
psiblast -h 查看工具的帮助文档，里面的num_iterations 增加迭代次数，例如为5。max_target_seqs 限制迭代中用于更新 PSSM 的序列数，可以增加，例如为50、100.
回答于 2025-06-19 14:24
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老师，这是我做提取可靠基因家族成员的结构域序列用到的文件和代...
一步一步结果检查：先看${ind}.FAE1_hmmerOut.final.txt 文件内容是否正确
回答于 2025-06-13 10:46
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老师，这是我的gene.list和其他文件的基因，不是只有一个，而且...
不太清楚你说有错误的文件是做哪步分析得到的结果文件有错误。你是基因家族成员鉴定之后提取domain序列的时候出现问题的吗？是运行那行代码有问题的？可以把运行的代码和代码用到的文件截图出来。
回答于 2025-06-12 09:23
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蛋白3D结构预测
psi-blast有的蛋白序列没有结果可以修改参数重新运行，或者用swiss-model找模板预测结构。 有时候网络问题运行py脚本得不到模板文件，可以直接去pdb数据库下载对应模板
回答于 2025-06-11 09:19
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cytoscape没有layout
课程里面有如何安装Cytoscape插件的内容。找到cytoscape的“App Store” 搜索“ yFiles Layout Algorithms”。点击插件链接进入网页“install”即可
回答于 2025-06-10 09:31
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