红橙子
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老师,请问一下颠茄的基因组数据哪儿可以找到呢?

你好,可以试着学着自己下载基因组,学习链接:https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIyNzIyNTczNA==&mid=2247486726&idx=1&sn=cad82d7a2f1b2f3f523cf77fbc1438c9&chksm=e86534efdf12bdf9ce1666a085ee28621cae54be92e9787f5ba5612952973c64c6d2616f12fd&token=819885636&lang=zh_CN#rd

回答于 2019-03-31 19:13

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蛋白质组:血液样品怎么准备?

血浆样品:EDTA抗凝剂和蛋白酶抑制剂的血常规管采集血液;轻轻地上下颠倒混匀 8-10 次;立即4℃,1600 g离心 10 min;将血浆转移到离心管中,加入蛋白酶抑制剂,混匀,瞬时离心。 血清样品:真空采血管收集血液;轻轻地上下颠倒混匀5-6 次;4℃,静置15-30 min;4℃,1600 g离心10 min;上层淡黄色血清转移到离心管中,加入蛋...

回答于 2019-03-29 17:01

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蛋白质组样品准备-需要多少量?

动物组织不少于200mg;叶片等植物组织不少于1g,菌体湿重不少于100mg;贴壁细胞不少于10的7次方个。

回答于 2019-03-29 16:57

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物种有基因组,但是转录组做的无参,能分析基因家族的基因结构吗...

建议您将转录组数据按照有参转录组方式再重新分析一遍,然后再用作基因家族分析,如需要分析可以联系微信llcheng1314.

回答于 2019-03-27 17:34

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请教一下,如果基因组注释文件不是染色体序号而是scaffold序号,...

是的,说明没有组装到染色体水平。

回答于 2019-03-21 16:20

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请教一下,可否用一个物种基因家族的保守结构域序列和另一个物种...

一个结构域,一个全长肯定不行,两个序列要保持一致!

回答于 2019-03-21 16:19

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我只关注黄酮代谢相关的基因,能否只提取这部分基因来做差异分析...

不能。差异分析是基于整体来做的,需要用全部read count进行差异分析,若使用部分基因做分析,会破坏数据整体的特点,如测序深度、reads分布特征等,所以不推荐抽取部分来做差异分析,只能整体做完差异分析后再提取这部分基因查看表达模式。

回答于 2019-03-21 10:55

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某基因在两个样本中表达量差别很大,分析结果却是非显著差异基因...

差异基因的筛选是基于统计学意义的,不能仅仅通过一个基因在两个样本中表达量数值的大小判断差异表达是否显著。差异显著情况可通过矫正后的p-value来看,矫正后的p-value越小,差异越显著。同时也可结合log2Foldchange值来判断差异的大小情况,log2Foldchange越大,差异倍数越大。

回答于 2019-03-21 10:52

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我的榆树转录组为什么没有可变剪接分析内容?

你好,据我所知,榆树目前还没有可用的参考基因组,可变剪接分析需有参物种才能分析,所以无参物种中没有可变剪接分析内容。

回答于 2019-03-15 15:53