160 个回答
原核生物与真核生物在进行转录组测序文库构建时有什么区别？
在原核生物中，mRNA只占全部RNA的1-5%，其余绝大部分是核糖体RNA（rRNA），因此若要测序mRNA，首先必须先将mRNA纯化出来，然而，原核生物并不像真核生物mRNA具有polyA的结构，因此，无法直接利用oligoT将mRNA纯化出来，如果拿total RNA进行测序，那么测序的效率一定会非常差，因为大部分的序列都来自rRNA。目前，提高原核生...
回答于 2019-03-08 15:45
如何从种类繁多的GO和KEGG富集条目中找到自己关注的？
GO（Gene Ontology）是一个国际标准化的基因功能分类体系，具体分为分子功能（Molecular Function，MF）、生物过程（biological process, BP）、和细胞组成（cellular component, CC）三个ontology。根据实验处理条件，分别从三个层面挖掘显著富集的GO功能条目，比如研究叶片颜色，我们可以挖掘CC层面的叶绿体，类囊体膜成...
回答于 2019-03-08 15:43
为什么编码同一个酶的基因，会出现有的上调有的下调？
主要原因有两个：1. 不同的基因具有相同的功能：不同的基因通过注释具有相同的功能，而不同的基因其差异情况并不一样；2. 许多酶是复合物：组成酶的复合物包含了一个家族的多个基因和不同的调控因子，它们之间的调控机制尚不清楚，反映在图上会有部分上调，部分下调。
回答于 2019-03-08 15:42
植原体是细菌还是病毒？
植原体是一类类似细菌、但没有细胞壁的原核生物。该微生物是一类无细胞壁的原核微生物，具有容易受外力作用而破碎的单位膜，能够通过筛板间的胞间连丝而移动，大小为50－1100 nm。因其无细胞壁，在细胞内易受到外力作用的影响而呈现出各种不同的形态，一般有球形、长杆形、椭圆形、带状形、梭形、多态不规则形状。植原体主...
回答于 2019-03-01 14:11
重测序一般测多少深度合适？
看待这个问题需放在特定条件下来说，假如检测几个样本间的结构差异及亲本开发snp，建议30乘以上，假如是自然群体，做gwas一般5乘以上，做遗传进化最好10乘以上，具体项目具体分析，仅供参考！
回答于 2019-03-01 14:07
微生物多样性中相对丰富怎么计算的？
相对丰富一般有六个水平数据，如门纲目科属种，以门为例，某样品中注释到该门的tags比上该样品中所有能修饰到的tags数，即是该门微生物的相对丰富！
回答于 2019-03-01 13:59