红橙子
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原核微生物多样性扩增16sDNA还是16sRNA?

原核生物基因组有别于真核,没有内含子间区等,所以16sdna与表达出的16srna序列是一样的,区别在于一是基因组序列,一是表达出的序列,所以叫16srna,也没啥影响,但提取自然是DNA,扩增的也是DNA。

回答于 2018-08-08 23:24

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有参转录组分析过程存在组装过程吗?

有参转录组是存在组装过程的,但是部分组装,在分析新基因,可变剪接时是需要组装的,其他已知基因的表达定量不需要组装。

回答于 2018-08-06 10:08

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我的转录组数据与参考基因组比对后发现基因间区及内含子比例较高...

一般造成内含子及间区比例高有以下2个方面原因:1.基因组注释较差,大部分是这个原因,尤其非模式物种,刚测序物种等,2.有DNA污染,可结合RNA检测结果识别,一般较少出现。

回答于 2018-08-06 10:06

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有参转录组结果中有基因CDS序列信息吗?

在北京组学生物科技有限公司的有参转录组结果文件中是有基因cds序列信息的,位置在Gene_Func_Anno下面的NewGene文件夹中的All.longest_transcript.fa文件里,少量的话自己可以去提取。

回答于 2018-07-16 11:00