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GWAS假阴性过高,请问怎么解决

1.检测模型的power不够,可以换blink farmCPU重新分析试试 2.位点本身由微效位点控制,样本数量不够检测效能不够,可以增加样本量 3.样本没有群体结构矫正过头,可以去除群体结构矫正

回答于 2024-01-14 21:00

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snp密度图绘制

看看46行有没有异常:检查是否有单引号或者双引号,如果有可能导致R读取报错;

回答于 2024-01-14 20:57

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循环

循环可以的; 每个文件夹里面只有一对fastq文件吗,不然可能会有可能报错;

回答于 2024-01-14 20:56

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CNV拷贝数变异分析

CNV做不了这些分析的;硬要做需要做格式转换;

回答于 2024-01-14 20:54

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老师您好,我现在有一组扩增子数据,但是这一组数据是由不同引物...

简单的话你可以运行两次这个命令,依次去除; 或者可以这样 --p-front-f  ATCCC ATCG  多个引物后面空格隔开贴一下,这个没有测试,不知道行不行,你可以试一下;

回答于 2024-01-14 20:52

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进行snp信息注释,发现此类错误,请问为什么?

输入文件格式问题,需要查看代码测试才可以找到原因;

回答于 2024-01-11 11:42

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请问用相同的文件,只是把名字改了一下,然后docker自动把重复的...

最多出10个motif,motif 出现具有随机性

回答于 2024-01-11 11:41

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在做多物种共线性分析是出现输出空文件是什么情况

检查 bed文件和cds文件之间的基因ID是否一致;

回答于 2024-01-11 11:39

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apptainer/singularity

用SIF镜像分析数据没有测试过,建议用docker吧

回答于 2024-01-10 16:17

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GCVF合并

都加上吧,基因组的一部分不能少 了;

回答于 2024-01-10 13:18