3 单细胞测序分析时快速找出所有细胞类型的差异/Marker基因，执行代码后报错
老师，您好！单细胞测序分析时快速找出所有细胞类型的差异/Marker基因，执行代码后（Rscript $scripts/seurat_FindAllMarkers.r --rds $workdir/05.cell_type_ann/pbmc.added.celltype.rds \
-p FindAllMarkers --test.use DESeq2 --logfc.threshold 0.25 ）报错，想请教老师是哪里出现了问题，应该怎么解决？谢谢老师！
最佳答案 2024-01-28 17:08
可能是marker差异基因没找到，你换个方法：DESeq2 ，降低阈值等再试试；
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