omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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重测序circos运行失败

你的基因组组装到染色体了吗？没有组装到染色体会有很多scaffold，把那些短scaffold多删除一些，试试；

回答于 2024-03-04 09:17

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这个只是标识，对数据分析没有影响，简单可以写 BGI

回答于 2024-03-01 10:14

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代码么有错的话，可能是你过滤的太严格了，放低这个值试试：meanFPKM

回答于 2024-03-01 10:02

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避免软件安装问题，可以使用我们组学大讲堂提供的docker镜像，及视频课程：https://bdtcd.xetslk.com/s/24yiRs 不同linux系统软件安装会有不同的报错，这边不好回答

回答于 2024-03-01 10:00

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解决办法： export JAVA_HOME=/share/work/biosoft/java/latest/ 再安装 rJava包

回答于 2024-02-29 16:11

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输入文件格式有问题吧，你看看文件里面建议列名和行名不要有空格；

回答于 2024-02-29 09:26

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不同的样本，可以分开执行的；这里有一些shell基础你可以看看学习一下：https://www.omicsclass.com/article/1006

回答于 2024-02-29 09:23

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基因组太大了吧，你看看samtools的帮助的；

回答于 2024-02-28 13:10

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把对应的染色体号改成你的染色体号就行了；

回答于 2024-02-28 13:07

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建议下载系统对应的版本用yum安装：https://www.omicsclass.com/article/1887

回答于 2024-02-27 10:42