omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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使用GATK的GenomicsDBImport合并gvcf导入db时报错Unexpected com...

检查这个文件上一步是否正确生成，如果没正常生成重新生成这个文件：BN14.g.vcf.gz

回答于 2024-03-14 17:48

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没有报错信息或者中断，就是在运行中，这个时间久耐心等待；

回答于 2024-03-13 11:20

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系统版本导致的，需要重新编译软件才行；可以使用我们的服务器：https://study.omicsclass.com/index

回答于 2024-03-13 10:18

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不用，重新运行这行代码即可；

回答于 2024-03-13 10:15

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过滤SNP的时候应该过滤一下SNP cluster；你这个应该是么有过滤导致的，你可以在绘图的时候把距离太近的值去掉再做这个图；这些在我们重测序课程和遗传进化课程里面都有讲解：https://bdtcd.xetslk.com/s/RCGWQ

回答于 2024-03-12 18:34

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课程里面有一节课程有介绍课程资料获取方式：https://bdtcd.xetslk.com/s/2TnPfm

回答于 2024-03-11 20:11

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自己搭建的docker服务，建议找管理员沟通；

回答于 2024-03-11 20:09

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注意空格：这种写法没有测试过，建议和课程里面一样，把这些染色体名字每个一行，做一个列表文件；输入；

回答于 2024-03-11 20:08

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基因家族分析课程里面有讲解，你可以看看课程的：https://bdtcd.xetslk.com/s/1BAqPp

回答于 2024-03-11 09:28

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单倍型分析这部分内容正在更新，请关注课程：https://bdtcd.xetslk.com/s/RCGWQ

回答于 2024-03-08 07:50