如何从重测序的原始数据中提取某个基因序列?

请问老师,手里有很多样本的重测序数据,想把某个基因的序列全部提取出来,是可以直接从比对文件中,按照染色体的位置提取?还是说可以根据基因ID进行提取呢?我知道vcf文件是不可以的,vcf文件里是SNP的信息。

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

基因的序列你直接到参考基因组里面看GFF文件;找到对应ID到cds文件里面提取即可;

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  • shidandan 提出于 2024-03-28 09:23

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