3 使用tassel对vcf文件进行 -SortGenotypeFilePlugin 基因型排序时自动锅炉掉了我的两条contig,这个问题怎么解决呀?

我要做Gwas分析,需要生成hapmap文件,但是我直接用vcf转hapmap会报错Please first use SortGenotypeFilePlugin to correctly order the file.所以我就用tassel去排序然后可以正常生成hapmap文件了,但是我的两条比较小的contig不见了

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

可以再检查看看的,可能你没看到吧;


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  • 李念 提出于 2024-04-18 12:25

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