窗口和步长没有固定的,你可以根据基因组大小,平均连锁距离来合理设置; 基因组大可以适当加大窗口长度,L D连锁大也可以加大窗口; 也可以多试试几组数据,看看哪个效果好用哪个了;
回答于 2024-04-15 18:29
你的genomescope 评估基因组,图很奇怪,可能是测序的数据量不够导致,一般建议基因组测序50X以上评估;数据量太少评估不准确,你看看你的数据量相对基因组是否足够; 组装抱错,这个就抱错信息可能是时间久服务器断开了,组装时间比较久,建议你把任务转后台运行吧;
回答于 2024-04-15 12:34
内存不够 系统killed ,你可以多给docker 容器内存: https://www.omicsclass.com/article/1413
回答于 2024-04-15 07:48
内存不够 系统killed ,你可以多给docker 容器内存: https://www.omicsclass.com/article/1413
回答于 2024-04-15 07:48
你的输入文件有问题,你打开都看看的和课程里面的对比一下; 分组文件可能格式错误;有一行少了信息;
回答于 2024-04-12 17:36
输入基因上游的promoter序列,可以根据基因位置在基因组上截取: 我们基因家族课程里面有详细的分析讲解:https://bdtcd.xetslk.com/s/1BAqPp
回答于 2024-04-12 10:01