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关于ka/ks报错
请导入我们提供的百度网盘中的biolinux虚拟机，里面内置了很多软件:https://www.omicsclass.com/article/526 你这个应该是没有安装KaKs_Calculator2.0这个软件；导入百度网盘里面的biolinux，里面已经安装了这个软件； linux基础不好建议学习：linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境、linux命令处理生物大数据
回答于 2019-09-10 09:11
mcscanX 绘制共线性圈图报错family_circle_plotter
遇到这个问题，应该首先检查文件路径是否写错，文件格式总染色体基因ID是否统一； 如果以上检查都没有问题：可能是windows和linux系统编码的问题导致的，在linux中换行符一般是\n 而在windows中是\r 因此为了统一，应该统一编码UTF-8 千万不要用记事本：https://www.omicsclass.com/article/395 或者查看一下，gff文件...
回答于 2019-09-06 18:29
绘制火山图时出错
看代码应该是group有问题，至少应该有两个分组水平才行，你看看group里面是不是全部一样？如果是全部一样说明没有分组； 代码中文乱码建议设置一下：https://www.omicsclass.com/article/294 R语言及基础不好建议学习：R语言快速入门与提高
回答于 2019-09-06 09:45
我按照要求安装了blastall 请问一下blastall为啥没有这个指令
blastall是早期blast版本里面才有，建议安装blast-2.2.26 以前的版本；
回答于 2019-09-05 14:49
保守结构域
NCBI中CDD可以查看保守结构域：https://www.omicsclass.com/article/310 可以下载信息，找到对应的序列看看完整与否； 关键是你自己要对自己研究的基因家族非常了解，建议多看看文献；
回答于 2019-09-05 14:47
基因家族问题
这个和基因结构与染色体位置分析没有关系，你直接做就可以了； 更多基因家族分析可以观看视频教学：学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读
回答于 2019-09-05 14:41
共线性
不知道你的基因家族共线性怎么跑出来的？ 全基因组共线性又是用什么方法得到的？ 如果两种不同的方法出现差异，可能某些参数设置有差异导致，属正常现象，以一种方法为准就行；
回答于 2019-09-04 15:35