你先了解一下NBS基因家族的特点,一般NBS基因家族基因大多会有LRR结构域,如果想下载的话上面有个sent to 可以批量下载序列; 一些模式植物中的NBS家族基因数量是已知的,建议通过文献查找获得基因ID号,直接到拟南芥基因组里面查找对应序列就可以,不用到NCBI上搜索下载序列,可能有很多重复的序列; 记忆家族分析建议学...
回答于 2019-09-24 11:41
可以参考这里搭建一个本地GSDS网站,就不会打不开了:https://www.omicsclass.com/article/1308
回答于 2019-09-23 20:35
只有三对 想找到与籽粒相关的SNP很难,或者是不可能的。 如果是测的混池,可以按照bsa,mutmap关联一下与性状相关的SNP。https://www.omicsclass.com/article/331
回答于 2019-09-23 15:29
这个错误是文件路径不存在, /biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python 如果是这个路径不存在 说明你安装的biolinux不是我们组学大讲堂提供的,你从新下载安装我们百度云盘里面的biolinux就可以:https://www.omicsclass.com/article/526
回答于 2019-09-23 15:27
R语言和perl语言都可以做到,文件太大的话建议用perl语言; R语言用 %in% 可以做到,perl语言用hash就可以; perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高
回答于 2019-09-23 09:46
虚拟机文件ova文件下载不完整,重新下载安装一下:https://www.omicsclass.com/article/526
回答于 2019-09-20 15:41
会修改环境变量吗? 把这个文件的最后一行修改一下; ~/.profile 用默认的python就可以了:
回答于 2019-09-20 11:32
可以分析,基因型分析可以做群体的重测序得到SNP按照不同的基因型进行分型; https://rqtl.org/ Rqtl 包做QTL定位,还有map QTL做定位的:https://www.kyazma.nl/index.php/MapQTL/
回答于 2019-09-20 09:52
数据量太大的话,应该不可以,要么分析速度很慢,要么你的电脑吃不消,硬件达不到,存储内存等; 建议使用linux服务器分析高通量测序数据;
回答于 2019-09-20 09:48