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你好,我想问一下,为什么分染色体提取的序列有的能全部提取到,...

如果输入的文件只有一条信息,当然出一条序列了;  看你做的应该是小麦的,有可能是染色体太大,内存限制了;

回答于 2019-09-29 09:52

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Trimmomatic软件可不可以去除hiseq4000的接头

只要知道具体的接头序列就可以去除。接头序列可以咨询测序公司。一般测序公司给的数据都是去过接头做过质控的,你不需要处理。

回答于 2019-09-29 09:44

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您好,我在数据库中搜索到了某个物种基因组测序的SRA序列,但没...

SRA数据库里面都是高通量测序的原始数据,不能对基因家族基因进行注释; 我想你是想做基因家族表达量分析吧,那基因组重测序数据不能做表达分析,你需要找转录组测序数据才行;

回答于 2019-09-29 09:43

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无参转录组比对达到多少。认可为相应基因?

没明白你的问题,无参转录组是通过转录组的reads 组装出来的unigene,和比对没么有关系。

回答于 2019-09-29 09:41

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基于R语言开发的软件包存放在哪里?

R的包绝大多数都存放在这两个地方,也有在GitHub上的,这个你要用哪个包,看看包的说明就知道了;

回答于 2019-09-29 09:40

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基因家族在求串联复制是,是自己写perl 脚本根据在染色体上距离...

这是两种方法分析相同的问题,任选其一的结果就行。

回答于 2019-09-29 09:39

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eclipse 安装好了,也打开了,不过安装不了Perl和pydev.既不显示...

你点一下learn more 看看为啥不能安装。 我刚刚试了我的eclipse是可以安装的; 

回答于 2019-09-26 14:09

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请问老师转录因子数据库,PlantTFDB为撒进不去啊,撒原因

服务器在维护吧,你可以搜索文献,给作者写信问一下,这个作者是中国人好沟通。

回答于 2019-09-26 10:12

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转录组的差异基因的注释

有参转录组,要到参考基因组中去找;当时做分析,一般公司都会和你沟通用哪个参考基因组,不能直接到NCBI上搜索; 一般公司做了转录组,都会有基因的注释信息,你不用再到NCBI上去注释;  想研究某个功能直接在注释里面搜索关键字就好了; 对转录组分析不了解建议学习:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读

回答于 2019-09-26 10:11

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顺势作用元件问题

检查输入文件是否一条染色体上只有一条需要截取序列;

回答于 2019-09-25 12:17