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比较基因组学构图(物种间共线性分析时),手动生成两个配置文件...

看看这个文件里面的染色体ID与bed,里面的染色体ID是否一致: 更多可见:https://www.omicsclass.com/question/1361

回答于 2020-01-08 13:43

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比较基因组学构图(物种间共线性分析)时,anchors生成时,内容...

查看一下,bed里面的基因ID与cds里面的基因ID是否一致。

回答于 2020-01-08 13:38

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平台信息下载不下来,还有别的解决方法吗?

换个网络重新下载试一下。 再下载不了可以,手动下载原始rawdata,手动标准化得到表达量。

回答于 2020-01-08 13:36

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玉米单个基因与性状的分析

类似这样的文章,大麦开花基因(Ppd-H1)适应性遗传进化分析:https://academic.oup.com/mbe/article/25/10/2211/1031345

回答于 2020-01-06 13:07

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老师,您好。我用这个流程做另外一个基因家族,从ncbi下载下这些...

sra数据为测序数据的原始fastq数据,需要自己做转录组比对定量表达分析,建议实验室有计算机服务器才好分析: 转录组自主分析课程:二代测序转录组数据自主分析 自己分析比较困难,可以找我们组学生物分析。

回答于 2020-01-06 12:56

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请问老师,WGCNA分析后,得到模块里面基因太多,cytoscape做图的...

可以根据weight值大小,筛选前150个基因来显示网络。

回答于 2020-01-06 12:53

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如何手动将aln转成axt?

cds比对可以先蛋白比对,再转换成cds比对,就不会出现这种情况了: 批量比对计算参考这里:https://www.omicsclass.com/article/1939

回答于 2020-01-06 12:52

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加倍分析时没有一条红色线,正常吗

有可能的,你可以检查一下数据确认一下;

回答于 2020-01-06 12:50

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mega构树

建议用evolview美化进化树:https://www.omicsclass.com/article/671

回答于 2020-01-06 12:48

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基因的收缩与扩张

没有这方面的课程

回答于 2020-01-04 12:57