这些参数和最终的绘图有关,可以稍加调整重新绘图,看看图片有啥变化,第一行是表头; 详情可看这里:https://www.omicsclass.com/article/284
回答于 2020-02-23 19:17
这个python版本的mcscan 显示染色体的时候只会显示染色体上的数字, 建议那些太短的scaffold就不要显示了,也没有共线性关系。
回答于 2020-02-23 19:12
共享目录设置方法见:https://www.omicsclass.com/article/260
回答于 2020-02-23 11:46
不要批量运行代码,初学者应该一行一行的运行代码确保每一步代码的运行意义,以及是否运行正常。 如果批量运行,很难找到错误原因;
回答于 2020-02-23 11:45
树枝上的数字,需要你在构建进化树的时候选择bootstrap才有;
回答于 2020-02-21 19:40
截取序列可以利用Linux工具samtools:https://www.omicsclass.com/article/1169 也可以自己编写脚本截取,perl或者python,下面有相关课程你可以学习一下。 生物信息入门到精通必修基础课:linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速...
回答于 2020-02-21 19:38