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采用RSeQC 对bam 文件进行质控分析时，用inner_distance.py报错...
python中没有正确安装好pysam这个包：pysam 查看你的默认的Python中是否安装了这个包。 或者检查你的默认的Python里面是否正确安装：RSeQC 这个包 Linux基础不好建议学习：linux系统使用、 生物信息入门到精通必修基础课：biolinux搭建生物信息分析环境、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语...
回答于 2020-02-10 10:38
请问用什么软件可以批量的将CDS序列中最长的ORF序列提取出来？
这个可以自己写程序完成，perl或者Python，如果会分别会bioperl或者biopython就很好写这个脚本程序了。 建议学习以下课程： 生物信息入门到精通必修基础课：linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到精...
回答于 2020-02-10 10:10
之前导入过，卸载重新导入出问题了 如下图
删除虚拟机的时候一定要选择删除所有文件。 建议检查ova文件是否下载完整，或者重新下载一个。 虚拟机所在的目录（D:\work\VM）建议换个目录试试。
回答于 2020-02-10 10:08
clustalW构建出来的系统发育树打不开是什么原因？
clustalw是做多序列比对的，不能构建进化树，dnd文件为序列之间的距离文件，mega可以用这个文件构建进化树。如果序列少想用mega构建进化树，可以使用mega自带的clustalW多序列比对然后构建进化树。
回答于 2020-02-09 11:41
TCGAbiolinks使用求助
刚刚测试了一下，当TCGAbiolinks 为2.10.5版本的时候会报错这样的错误，应该是个bug。建议重新安装TCGAbiolinks 更新到最新版本可以解决以上问题，并且R的版本也更新到最新。 建议把下载的数据全部删除，重新下载数据后再整理，试一下。 query <- GDCquery(project = "TCGA-OV", data.category...
回答于 2020-02-09 11:37
Error in seq.default(grps[start] + 1, grps[start + 1] - 1) :...
R 包安装技巧见：https://www.omicsclass.com/article/106 设置国内镜像加快安装进度。
回答于 2020-02-09 11:33