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clustalw2多序列比对,序列输入不进去

检查你输入的序列里面的的ID是否有重复的,如果有重复的会出现输入不进去。 参考:https://www.omicsclass.com/question/1621

回答于 2020-01-10 09:30

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SNPcalling的方式有samtools结合bcftools,或者bcftools,或者ga...

SNPCalling 两种方法: samtools结合bcftoolsGATK  以上两种方法任选其一就可以

回答于 2020-01-10 09:27

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你好,老师,能用R语言软件分析GEO数据库中关于lncRNA、microRNA...

当然可以了,你可以找到GEO中甲基化芯片数据,然后再利用R语言中相应的R包进行分析就可以了。

回答于 2020-01-09 11:17

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请教用gtf文件获取基因与mRNA的对应关系的问题

脚本要求输入gff格式的文件才可以正常运行,不要输入gtf格式的文件,会报错; 请 下载参考基因组里面对应的gff文件再运行此脚本。 另外,gff文件是可以转换成gtf文件,但是gtf文件无法转换成gff文件。

回答于 2020-01-09 11:12

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请教!基因结构分析出现这样的问题如何解决?

我看你的命令行输入的是拟南芥的GFF文件,但是截图是其他物种的,请确保自己的文件里面的信息来自于同一物种的一套参考基因组; 不同物种基因ID不一样,染色体也不一样,程序肯定会报错的;

回答于 2020-01-09 11:10

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在提取1500bp序列做顺式作用元件检测时,使用tiquxulie.pl这个脚...

建议你提高自己笔记本的内存,详细信息见:https://www.omicsclass.com/question/1231

回答于 2020-01-09 11:08

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你好,老师。同一个基因用视频流程获取的启动子序列2kp,是mRNA...

不太明白你的问题,你可以截图说明问题

回答于 2020-01-08 13:45

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比较基因组学构图(物种间共线性分析时),手动生成两个配置文件...

看看这个文件里面的染色体ID与bed,里面的染色体ID是否一致: 更多可见:https://www.omicsclass.com/question/1361

回答于 2020-01-08 13:43

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比较基因组学构图(物种间共线性分析)时,anchors生成时,内容...

查看一下,bed里面的基因ID与cds里面的基因ID是否一致。

回答于 2020-01-08 13:38

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平台信息下载不下来,还有别的解决方法吗?

换个网络重新下载试一下。 再下载不了可以,手动下载原始rawdata,手动标准化得到表达量。

回答于 2020-01-08 13:36