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4106 个回答

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老师,您好!我在进行基因家族的分析时,在利用.aln文件获得新的...

二次搜索是可选分析。 e值低可以酌情删除

回答于 2020-02-22 23:23

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请问老师我在MAFFT上构建进化树,结果是This is a Neighbour-joi...

树枝上的数字,需要你在构建进化树的时候选择bootstrap才有;

回答于 2020-02-21 19:40

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提取一条染色体序列上的某个位置的序列,比如提取1号染色体16000...

截取序列可以利用Linux工具samtools:https://www.omicsclass.com/article/1169 也可以自己编写脚本截取,perl或者python,下面有相关课程你可以学习一下。  生物信息入门到精通必修基础课:linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速...

回答于 2020-02-21 19:38

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R安装包报错ERROR: failed to lock directory

解决办法增加--no-lock R控制台安装 install.packages("stringi", dependencies=TRUE, INSTALL_opts = c('--no-lock')) R命令行安装 R CMD INSTALL --no-lock <pkg>

回答于 2020-02-21 16:02

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安装MCScanX make命令找不到 Command 'make' not found,怎吗解决...

软件安装不会建议学校linux基础,里面有详细软件安装讲解:linux系统使用 如果不想安装软件可以导入我们组学大讲坛提供的biolinux 里面已经安装了mcscanX可以直接使用。 https://www.omicsclass.com/article/526

回答于 2020-02-21 14:44

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在使用R语言read.table的时候,一直提示“'row.names'里不能有重...

第一列的数据有重复的,可以尝试删除重复值, 相同的ID去平均值可以用apply  或者aggregate 函数完成:更多R语言学习可以:、R语言画图、R语言快速入门与提高、

回答于 2020-02-19 16:42

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甲基化探针cg号转换为基因名

这种标签可以删除不用

回答于 2020-02-18 16:34

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请问老师我下载了根,茎,叶,花,种子的转录组数据,怎么做成基...

如果只有原始数据fastq文件或者NCBI上下载的sra数据,就需要自己手动比对,定量分析。如果没有实验室没有服务器,自己得笔记本分析原始测序数据很吃力,不建议分析。 有兴趣可以看这门课程:二代测序转录组数据自主分析 我们公司也也可以分析转录组数据,可以联系我们,18510686772

回答于 2020-02-17 10:03

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您好,我想问下使用CMplot包绘制曼哈度图,怎么能让某个感兴趣的...

cmplot 好像没有这个功能。 建议单独绘制这条染色体,然后用AI合成两张图:

回答于 2020-02-17 09:57

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你好!我在Rstudio中做cox分析时由于数据量巨大,有37万之多,目...

电脑性能差,还有基因数量多运行时间就会长。 你也可以先取少量基因测试一下

回答于 2020-02-17 09:51