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R 语言做lncRNA-mRNA皮尔森相关性分析correlation
lncRNA功能主要通过cis或trans（进行trans作用分析需要至少5个样品）方式作用于蛋白编码靶基因来实现； Cis作用靶基因预测基本原理认为lncRNA的功能与其坐标临近的蛋白编码基因相关，于是将lncRNA临近位置的(上下游100k)蛋白编码基因筛选出来作为其靶基因。trans作用靶基因预测基本原理认为lncRNA的功能不依赖于和编码基...
回答于 2020-02-24 11:08
老师我想问一下用circos绘制基因组内共线性图时，config2.txt文...
用以下配置文件会更好： chromosomes_units=1000000 #刻度单位Mbkaryotype=./chr.info #染色体信息配置文件show_tick_labels=yesshow_ticks=yesspacing=10u<ticks> #设置染色体刻度 color=black format=%d multiplier=1e-6 radius=1r thickness=2p <tick> size=10p sp...
回答于 2020-02-24 10:04
mcscan_layout参数都是有关什么呢？求教
这些参数和最终的绘图有关，可以稍加调整重新绘图，看看图片有啥变化，第一行是表头； 详情可看这里：https://www.omicsclass.com/article/284
回答于 2020-02-23 19:17
mcscan作图时，染色体片段比较小，显示不出来怎么办？？请教
这个python版本的mcscan 显示染色体的时候只会显示染色体上的数字， 建议那些太短的scaffold就不要显示了，也没有共线性关系。
回答于 2020-02-23 19:12
我按照系统说明进行biolinux的安装，但是在设置共享文件夹时总是...
共享目录设置方法见：https://www.omicsclass.com/article/260
回答于 2020-02-23 11:46
你好！我参照《医学癌症TCGA-甲基化生存分析》中的方法做甲基化...
不要批量运行代码，初学者应该一行一行的运行代码确保每一步代码的运行意义，以及是否运行正常。 如果批量运行，很难找到错误原因；
回答于 2020-02-23 11:45