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单细胞测序数据两个子集合并

  • Zzz 2025-04-27 17:18
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使用monocle3进行轨迹分析报错

  • Zzz 2025-04-27 16:56
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单细胞测序FindAllmarkers

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单细胞测序使用subset脚本提出子集，再进行拟时分析报错plot_genes_by_group

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拟时分析筛选出的差异基因数量太少，有没有可以调整的参数去增加筛选数量

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5 原核生物建立基因组索引出现问题，没有gtf在文件

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5 单细胞测序拟时分析没有“seruat”这个包报错

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20 GFF文件格式不标准

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单细胞测序生成的图片基因名字字体比较小，需要修改什么参数

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HISAT2比对时报错|sam文件为空白，summary文件为(ERR): hisat2-align died with signal 9 (KILL)

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hisat2中提示"/work/my_rnaseq/ref/Gmax_508_v4.0.fa" does not exist

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RNA-SEQ分析中，基因ID位于Chr01-Chr09的基因的reads数目全部是0

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Error response from daemon: Get "https://index.docker.io/v1/search?q=omicsclass&n=25": dialing index.docker.io:443 container via direct connection because has no HTTPS proxy: connecting to index.dock这是

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老师您好，我想咨询下关于这篇文章中《华大stereo-seq 添加上底片转换成10X格式方便scanpy和seurat读入分析？的gemTo10X.r脚本，不知道您是否方便发一下？还有这样转换成10×格式后会在分析上面产生一些报错吗？

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进行ka ks分析报错

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老师，拟时序基础初步分析时，运行以下代码时Rscript $scripts/cell_trajectory_monocle3.r --rds ../04.cell_type_ann_leaf/leaf.added.celltype.qs \ --use.seurat.umap --groupby mycelltype -o monocle3.1 --cpu 6，出现图中报错，是因为聚类分群的时候resolution值太低了吗

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Error response from daemon: Get "https://index.docker.io/v1/search?q=omicsclass&n=25": dialing index.docker.io:443 container via direct connect

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cellranger count 报错：job failed in stage code怎么解决

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老师，cellranger count 报错：job failed in stage code怎么解决

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老师你好。提取cds与pep序列报错显示 no sequence