原核生物建立基因组索引出现问题，没有gtf在文件 - 组学大讲堂问答社区

5 原核生物建立基因组索引出现问题，没有gtf在文件

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老师我做的是细菌转录组分析，按照代码跑发现最后生成不了tsv文件，请老师帮忙解答，感谢老师

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分类：转录组

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1 个回答

omicsgene - 生物信息 1天前

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

你单独运行一下 index.sh 里面的 gff3 转换gtf的命令，看看报错原因；

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东篱提出于 1天前