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5 用bHLH的第一个pfam号hmmer搜索不出来,是哪里出问题了？

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5 做基因家族分析上游顺作用原件分析时，启动子序列提取结果现显示如下

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老师请问我想做4个物种间的共线性分析，思路是和3个物种间的一样吗？我不知道该怎样排布这4个物种

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5 挂载共享文件夹，每次打开bio-linux都要重新挂载sudo mount -t……

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老师您好，我想问一下，有没有某一个基因家族在某一物种（不同的的进化过程，比如二倍体，四倍体，六倍体）的文章？谢谢

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绘制circos图，途中不显示共线性基因

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5 有没有大佬做过SMART本地下载分析呢？步骤是怎样的呢？

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5 求助，MCscanX分析基因家族绘制圆圈图时报错

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你好，我想问一下，要做小麦基因家族分析，但是有无参转录组数据，可以做吗？

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5 进化树构建模型的区别

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5 请问老师，基因家族里面筛选到很多对重复基因，那么kaks计算只能一对一对进行吗？准备文件也要一对一对分开准备吗？我把所有重复基因的序列号全部沾到dupid里面是不是不行的？上课的例子只筛选到了一对WRKY基因。谢谢解答。

  • LILA 2019-06-13 00:16
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5 MCscan运行问题：ZeroDivisionError: float division by zero

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5 问下在做基因家族进化树时，建的树bootstrap好多为0，这对发文章数据影响吗？还有要怎么分析解释呢

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5 老师好！做比较基因组分析时/biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.compara.catalog ortholog ATH OEH --cscore=0.7 报错

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10 章节1课时6，获取蛋白质序列以及提取1.5kb的DNA序列之前时总是不对，全是~~~~~~一行一个，不知道问题出在了哪里。还望有知道的能指点下。如下图

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5 按照课程中用MEGA建树时，一直建不成功

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顺势作用元件绘图时，图片有问题。基因id排列顺序乱

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小麦或单子叶植物的突变速率r

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关于基因上游顺势作用原件的分析及绘图操作步骤

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5 如果做想做基因家族分析，需要依据哪些基本原则？

  • 2019-05-24 15:53