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比较基因组学共线性分析
比较基因组共线性
荣
2020-08-15 01:55
1
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2947
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mcscan共线性分析
MCScanX
荣
2020-08-14 23:19
1
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2706
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老师,比如说我要做两个物种基因家族的对比分析,那我要不要选一个中间物种与这两个构建成一个进化树进行对比?
☪︎⋆.
2020-08-14 16:53
1
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3584
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5
提取保守结构域
基因家族
巴德
2020-08-13 12:21
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kaks计算
KaKs
荣
2020-08-12 10:37
1
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2765
浏览
老师,像下面这种同一位置有两种顺式作用元件的情况(两种元件全部或部分重叠),是取矩阵得分高的那1个吗?
顺式作用元件
Fighting!
2020-08-11 21:18
2
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2779
浏览
请问一下在做mcscan分析的时候pep.fa文件里只有3w多条蛋白序列,后面得到的AT.collinearity文件里显示9w多基因是什么意思啊?
MCScanX
荣
2020-08-10 12:50
1
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3187
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基因家族分析Mcscan分析时,无法提取蛋白序列。
共线性分析
荣
2020-08-07 09:56
1
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2445
浏览
老师您好! 我用get_gene_gff.pl提取基因在染色体上的位置信息时,得到的结果文件没有第一列基因ID,并且数量多出来了好几千,我的基因只有一百多个,请问老师这种该怎么处理呀? 我改了ID=gene为ID=也一样没有用
不悔
2020-08-06 12:57
1
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浏览
老师您好! 我用samtools faidx获取染色体长度时有一个segmentation default 报错,老师让我看看是不是文件里的序列长度不一致,请问老师具体该怎么处理呀? 我用软件打开基因组文件看了一下,但看不懂。
不悔
2020-08-06 12:50
1
回答
2309
浏览
在做MCScanX分析时出现exception in thread main java lang是怎么回事?
小代代
2020-08-06 09:48
1
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2987
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您好老师,我用get_gene_gff.pl提取的基因位置文件gene_chr.txt没有第一列基因ID,并且数量对不上,我只有一百多个基因,它提出了几千条信息,请问这种怎么处理呀?
GFF
不悔
2020-08-05 13:57
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2677
浏览
老师您好!我在用samtools获取染色体长度时报错,可能原因时Contig1中的序列长度不一致,这种具体该怎么处理呀?我看了它的序列是图上这种样子的
samtools
不悔
2020-08-05 13:53
1
回答
2910
浏览
老师,做共线性分析的时候,遇到下面这种情况,是需要什么脚本吗?
共线性分析
MCScanX
Fighting!
2020-08-04 18:50
2
回答
3197
浏览
老师,共线性分析可以全部用蛋白ID做吗?因为我看视频里面做拟南芥的组内共线性都是用的基因ID
共线性分析
Fighting!
2020-08-04 14:03
1
回答
2944
浏览
老师您好! 我在用samtools获取染色体长度时有一个different line length in sequence contig1报错,请问怎么处理啊
不悔
2020-08-04 12:13
1
回答
3112
浏览
请问smart可以批量下载蛋白质ID吗???
基因家族
SMART
学而时嘻嘻
2020-08-01 13:20
1
回答
3338
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5
blast建库比对
巴德
2020-07-31 17:50
1
回答
4635
浏览
请问在MEGA7.0中出现这种问题该怎么解决? No common sites found
MEGA
学而时嘻嘻
2020-07-29 14:08
2
回答
3269
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在做MCScan出现了一下问题,求解
MCScanX
bobo
2020-07-28 19:08
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