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老师，建立hmmbuild模型后，再用hmmsearch搜索，搜索结果比第一次的还多的情况是正常的吗？

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5 我想问一下，对于MADS-box这种辅助域的Pfam号和DNA-binding的Pfam号不同的基因家族，做成员鉴定的时候，需要下2个种子序列不？

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顺势作用原件功能评估

  • 大k 2020-07-15 11:12
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你好，我在对进化树的分支进行美化的时候，出现这种情况，求解，谢谢

  • bobo 2020-07-13 09:06
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5 基于perl 提取基因家族内的串联重复基因对的脚步具体该怎么写？

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20 一个物种里面某个基因家族的基因加倍与扩张的方式有哪些？

  • 2020-07-07 12:41
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各位老师好，按照组学大讲堂的方法，blast手动方法查找，得到的基因对都只符合1，两个基因相似度大于75% 2，比对长度大于75%（相对于较长的基因），但是都不符合基因在同一条染色体且距离小于100kb，请问得到的这些基因对是什么？应该不是串联重复基因吧？谢谢

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10 生成gene_exon_info.gff文件后不能得到基因结构图

  • zhoy 2020-06-28 23:41
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10 老师，我在做甘蔗基因家族分析，发现hmmsearch完了之后得到的序列与传统的名称不太一样，因为他染色体命名好像是1A2A3A4A,1B2B3B4B这样的

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请问HMM搜索，对于无蛋白文件的基因组，可以对实验室自有的转录组序列或数据做筛选吗？

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60 用TBtools绘制两个物种的进化树+motif+基因结构三连图时报错问题

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进化树+motif+基因结构采用之前课程中介绍的TBtools把三者合成一个图的时候，基因名字重叠（分析用的序列数154条），看不清，图中字体大小无法批量修改！PS:输入少量序列进行分析，物种基因名字不会重叠，能看清这种情况怎么处理呢？

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scaffold

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基因家族成员有多个保守结构域，一部分序列有全长，一部分只有不同的保守域该怎么分析

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老师，我在做基因家族鉴定，提取结构域序列，出现这样提示，请问怎么解决

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我在做mcscan分析的时候，出了这个问题，怎么解决啊

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老师您好，我用get_gene_weizhi.pl提取到的基因位置txt文件里边少了第一列(对应的基因ID号)，后边的几列信息都提取出来了。这种是什么原因啊

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10 请问老师们有关基因家族分析有利用较大数量物种（例如50种以上）研究某一家族基因的案例吗？

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目前我感兴趣的植物基因(全基因组测序未完成），仅仅在NCBI上公布了mRNA序列，大概有80个。请问可以进行基因家族生物信息学分析吗？

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请问GSDS老是打不开，还有其他软件作基因结构图吗？