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获取不了基因与mRNA的对应关系

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老师，您好！获取不了基因与mRNA的关系怎么办呢？下面是我物种的gff文件

  • 2023-04-26 12:13
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bed文件GSDS制作基因结构图

  • 荣 2023-04-20 23:08
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老师，您好，不能用GFF文件提取exon位置信息文件，结果文件是空的

  • 荣 2023-04-20 16:29
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下载gene family镜像总失败

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老师您好，请问蛋白序列有多个基因结构域，做系统发育树以哪个结构域为准呢

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老师您好，有多个结构域时，做系统发育树以哪个结构域为主呢？

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老师你好，我在再次搜索新建物种特异hmm模型时，显示segmentation fault，请问是怎么回事呢

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老师，麻烦您再帮忙看看下载镜像v2.0时出现了pulling fs layer，但是查找镜像时又显示有了2.0这个镜像，我下载成功了吗

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老师您好，我根据您的方法从GFF信息，从基因组里提取基因的蛋白序列和 cds序列，但是显示command not found，请您看看是怎么回事呢？上面写的代码要在分析镜像2.0中进行，但是课程给我们的只有v1.0.1，不知道是不是这个原因呢？

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motif展示

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请问在获取基因与mRNA的对应关系这一步，会出现提示说mRNA没有相对应的gene id 呢，可是文件中有gene id 呢，如图所示，而且输出的mRNAgeneID.txt里也没有转录本信息

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查看基因组文件里面有哪些信息时，除了CHr还有NSCAFA等其他的，是为什么呢

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10 基因家族分析：基因结构

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5 基因家族成员定位在scaffold

  • 2023-03-13 14:12
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老师好，我在进行染色体定位时，有两个基因显示不能定位到染色体上，这个需要怎么解释？我在后面顺势作用原件一系列的分析中，还需要分析这两个基因吗？麻烦老师解答，谢谢老师。

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5 基因家族成员鉴定cdd

  • 2023-02-28 15:24
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老师好，我在使用samtools进行染色体长度获取时出现了这种报错。此物种的gff3文件没有具体的染色体长度注释，以及使用基因组染色体的fasta文件进行统计的话数据很多，工作量很大，麻烦老师帮忙看看怎么解决这个问题。谢谢老师！

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想请教一下各位老师，做基因家族共线性分析的时候，出现这种情况是什么原因

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kaks批量提取报错