perl中的正则表达式

perl中的正则表达式

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• omicsgene
• 发布于 2018-07-20 15:00
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从Windows粘贴到linux的内容行尾会有东西？

将Windows中该文件的内容粘贴复制到linux文件中，用perl读取并保存到哈希中，然后读取另一文件的第一行，判断他第一列的内容是否在上一个文件中存在，结果总是不存在，然而明明就在啊，怎么会不存在呢，一遍遍检查代码也找不到问题。到底为什么呢？

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• 安生水
• 发布于 2018-07-13 15:14
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perl语言——正则表达式

正则表达式(regular expression)描述了一种字符串匹配的模式，可以用来检查一个串是否含有某种子串、将匹配的子串做替换或者从某个串中取出符合某个条件的子串等。 Perl语言的正则表达式功能非...

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• 安生水
• 发布于 2018-06-29 14:32
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SNP2CAPS使用

SNP2CAPS可将SNP转换为CAPS标记，其具体用法： perl SNP2CAPS.pl   chr5D:9950377.fa_1    link_gcg    AanI,AarI,AasI,AatII,Aba6411II,AbaB8342IV,AbaCIII   > chr5D:9950377.txt 其中...

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• 安生水
• 发布于 2018-06-22 15:44
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merged.gtf 合并同一转录本的exon位置

在merged.gtf文件中有所有外显子的信息，下面的脚本可根据此文件提取转录本的所有外显子位置信息。 merged.gtf文件实例： Chr00   Cufflinks       exon    37990   38333   .       +      ...

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• 安生水
• 发布于 2018-06-22 15:09
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perl处理文件路径

以前处理文件路径的时候都是自己写正则表达式，而用perl的模块来解决则更加迅速、准确。

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• 安生水
• 发布于 2018-06-14 15:51
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Perl读写Excel

生信分析是用的 .xls 文件 大多是文本格式的文件，是可以被Perl读取的，但遇到真的excel文件时，就不行了，这时候就需要使用模块 使用的模块为： Spreadsheet::ParseExcel Spreadsheet::Writ...

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• 安生水
• 发布于 2018-06-01 13:59
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perl 读取文件中的科学计数数字

Perl读取文件中的科学计数法数字是是以字符串读取的，需要将其转化为小数，方法如下 use Math::BigFloat;my  $i = new Math::BigFloat '1.931533e-01'; 这里用到了Math::BigFloat这个包，就...

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• 安生水
• 发布于 2018-06-01 13:11
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