awk统计某列中文本次数

awk统计文件中某列文本出现的次数

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  • 安生水
  • 发布于 2018-09-21 15:00
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awk命令实现列求和

awk命令实现按列求和

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  • 安生水
  • 发布于 2018-09-21 13:40
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三代纠错软件LoRDEC安装

纠错软件LoRDEC安装

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-09-04 11:08
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linux解压打包命令大全 tar gzip rar 等等

linux解压命令大全

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-09-04 09:55
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linux目录结构详细讲解

linux目录结构及说明

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-09-03 17:11
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linux中sed 替换

linux中sed 替换用法

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  • 安生水
  • 发布于 2018-08-31 14:11
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linux-列合并

linux中cat命令可以按行合并多个文件,而按列合并多个文件也是可以的。用到的命令是paste。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-08-24 15:41
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CentOS linux的环境变量配置

CentOS linux的环境变量配置

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-08-24 09:29
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利用sed 命令去掉windows下回车符

在Windows中文件的换行符与linux中是不同的,其在linux中显示为^M,在使用脚本处理时并不希望有这个符号,所以需要去掉此符号,其方法如下: sed  -i 's/^M//g'  test.txt    ^M 是回车换行符...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-08-23 18:22
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linux 从文件中随机抽取部分数据

如何从某一个文本文件中随机抽取一部分数据。譬如右下方这样的基因表达量数据的统计文件ref_trans_full_table.xls目标是由此文件中随机抽取一部分数据。 可以利用shuf获取随机数据,譬如随机...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-31 17:04
  • 阅读 ( 4458 )

linux处理fasta和fastq序列

linux命令处理fasta序列

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-21 22:46
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linux下解压命令

在下载或上传文件时,会碰到很多压缩文件,种类较多,这里就介绍一下各种常见类型的文件如何压缩以及解压缩

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-14 17:44
  • 阅读 ( 1737 )

fastq文件查看指定序列

在处理fastq文件时,可能会遇到序列与质量值长度不一致或格式不正确等问题,这时候软件会报告哪条序列有问题,并给出序列ID,然后我们就要去查看这条序列是什么问题。但是,fastq文件通常是很大的,使用less命令可能很难搜索到

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-08 11:48
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Bio-Linux中的生物信息学软件

Bio-Linux中有很多安装的生物信息学软件,这里给大家列举一下:

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-06 17:49
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linux系统中ls命令的常用用

ls命令是linux下最常用的命令。ls命令就是list的缩写,缺省下ls用来打印出当前目录的清单,如果ls指定其他目录,那么就会显示指定目录里的文件及文件夹清单。通过ls 命令不仅可以查看linux文件夹...

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  • landy
  • 发布于 2018-06-01 13:18
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linux 命令当中出现特殊字符无法传递参数怎么办

命令行特殊字符处理方法

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-31 11:03
  • 阅读 ( 7767 )

linux的简单命令(一)

linux

awk 判断并筛选数据

在linux上利用awk对数据进行筛选,并输出

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-17 09:41
  • 阅读 ( 7263 )

vi基本替换

利用vi实现文档的搜索替换

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-11 15:52
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linux命令如何对两个文件去重复

例如你有两个基因id文件,你想知道这两个文件共有的id,怎末办呢?一行命令就可以解决。cat     文件1  文件1  |sort|uniq    输出的就是这两个文件的并集cat     文件1  文件1  |sort|uniq   ...

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  • landy
  • 发布于 2018-05-11 13:54
  • 阅读 ( 2167 )