3分钟学会画venn图(维恩图、韦恩图)

3分钟学会venn图作图方法,不再求助公司!更多转录组分析技能就在组学大讲堂,感兴趣的小伙伴拉到文末观看吧!

venn图是转录组结果中的重要展示部分,能够找出各比较组之间共有和特有的基因,是最常用的转录组分析手段之一。但往往测序公司只给了几个固定组合的venn图,后期让公司补图,要加钱不说,两天给一副图的速度更是要命。

现在小编给大家讲一个在Windows下就能操作的,十分便捷的venn绘制方法:

一、输入数据准备:

首先要准备的是各比较组(比如CK1比上Treat1)的差异基因列表,一般公司做完的标准分析结果里已经包含这部分内容了,通常在“DEG_Analysis”文件夹里,我们需要的信息也不多,有差异基因的ID那一列即可,如下图第一列:

attachments-2019-07-MaQgTVEq5d1eb44c9b8e3.jpg

将各个比较组的差异基因ID整理到一个表里即可,对应关系要记好:

attachments-2019-07-xTnO5cNL5d1eb1e8bc539.jpg

二、在作图网站填入数据:

打开网站:http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html

在输入部分黏贴刚刚准备好的数据:

attachments-2019-07-jykMwZY75d1eb2576084b.jpg

这时你会发现在页面右侧,venn图已经做好了,我们再做些简单的调整就可以了:

attachments-2019-07-ooppY6Av5d1eb2834079a.jpg

当然我们也可以获得任一组合的共有基因列表:

attachments-2019-07-pU63BELF5d1eb30311abf.jpg

ok,一张venn图就做好了,掌握之后,便可在几分钟之内做任意组合的venn图而不用求助于公司了!

其实转录组的很多后续分析,都不难,完全不必求助公司,您需要的仅仅是高手领进门。

常用转录组数据挖掘技巧

想获取最常用的8个转录组数据挖掘技巧,可以观看下面的教程,让你可以省时省力的做自己想要的分析。

attachments-2020-04-zc1ZUjIQ5ea7f9aeeb1ac.pngattachments-2020-04-aMy1CaFn5ea7f9b5cb5aa.png

课程链接:https://study.163.com/course/introduction/1005084024.htm?share=1&shareId=1031472710

或者直接扫码观看:

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  • 发表于 2019-07-04 13:30
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  • 分类:转录组

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omics007
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