使用R包(VennDiagram)进行韦恩图绘制时相关参数调整

介绍一些VennDiagram常用的绘图参数

VennDiagram是绘制韦恩图时较为常用的一个R包,通过对其中的相关参数进行调整可以达到不同的个性化效果,今天我给大家介绍一些常用的绘图参数:

###
venn.plot <- venn.diagram(
gene_list,#输入的基因数据
scaled = FALSE,#不根据数据的大小来自动调节圆的大小
fill = c(“green”, “yellow”), # 区域填充色(以两组数据为例,下同)
filename = NULL, #指定不输出到屏幕
lwd = 2,#圆形边的宽度
alpha = 0.75,#着色透明度
cex = 2,#区域内部数字的大小
cat.cex = 2,#类名称(区域的label)字体大小
cat.col = c("cornflowerblue", "darkorchid1"),#类名称颜色
cat.pos = c(-15, -10),#以12点方向为起点,类名称绕圆心顺时针转动的角度
cat.dist = c(0.03, 0.03),#类名称距圆心的距离
ext.text = F,#当区域的数目太时,会自动使用引导线注释,可以通过F取消
ext.percent = 0 #或者自行决定阈值)
grid.draw(venn.plot);
dev.off()
###

绘图效果如下:

attachments-2023-09-cLvt9hQy6501227c20e8a.png

  • 发表于 2023-09-13 10:48
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  • 分类:R

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