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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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4105 个回答

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老师好,我在做课时20 比较基因组学分析时 最后生成的图有9个染...

检查你这9条染色体上基因的位置信息bed文件和cds文件是不是太少,缺了?

回答于 2018-12-28 21:58

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TBtools 的others界面下没有BioSequence Structure Drawers——Ama...

看好TBtools的版本,你的版本太老,你更新一下:https://github.com/CJ-Chen/TBtools/releases 这篇文章中的版本红色方框:https://www.omicsclass.com/article/382

回答于 2018-12-28 21:29

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Perl相关软件的安装

java版本不对,看看这个常见错误:https://www.omicsclass.com/article/229

回答于 2018-12-28 16:01

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基因家族成员如何取舍,命名?如何查找外显子和内含子结构?

1.无参转录组组装的结果,无法知道内含子外显子,所有这个结构没法分析,要是有参的可以到基因组注释文件gff文件得到基因结构信息; 2.关于基因的命令自己重新编号就行:可参考基因家族文献解读命名方法 3.不完整的基因可以舍弃,也可以不舍弃,写文章的时候说明一下就好了,不用纠结; 但是做分析建议用完整结构域的基因...

回答于 2018-12-28 14:24

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构建进化树出现问题

序列差异太大,删除些gap:https://www.omicsclass.com/article/221

回答于 2018-12-28 13:40

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老师好,我在做课时20 比较基因组学分析时 在/biosoft/miniconda...

看文件格式输入没有问题,检查Pt.bed文件ID找不到: 1.检查bed文件除了tab空白是不是还有空格 2.检查文件名字是否正确,Pt.bed  Pt.cds

回答于 2018-12-28 09:00

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做某基因家族共线性分析产生.collinearity 和.tandem这两个文件...

做错了吧,.collinearity文件是基因组所有的共线性关系,.tandem文件是基因家族串联重复结果,没有前面的结果,怎么会有后面的结果呢?

回答于 2018-12-28 08:46

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老师,我想请问一下您这里有Ai的安装包吗,因为我的那个Ai安装包...

这里有两个windows版本的你试一下可以不可以使用,不行的话你自己百度搜索吧,我也是搜索来的: 链接7天有效,抓紧下载: 链接:https://pan.baidu.com/s/1zwPVAiCVRaXLnv6D9cvvSg  提取码:829p  复制这段内容后打开百度网盘手机App,操作更方便哦

回答于 2018-12-27 14:01

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基因家族分析 hmmer 第四讲

数据检查: 1.请检查NB-ARC.txt文件第一列ID与  拟南芥所有基因的蛋白序列文件中的ID是否一致; 2.最后的  evalue参数设置,1e-20   确保1是数字,我看像  L

回答于 2018-12-27 13:21

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老师好,我在做课时20 比较基因组学分析时 在/biosoft/miniconda...

检查你的输入数据文件:有个文件结束位置大于开始位置:

回答于 2018-12-27 10:35