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老师,我在看菠萝的WRKY基因家族分析时,在看到基因组间共线性分...

红线是WRKY家族基因的共线性关系,但是不是所有的WRKY都有共线性关系,所以红线会少一些;

回答于 2019-01-02 12:43

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预测基因顺式作用元件,提取序列失败

基因组太大,内存不够,建议分染色体提取,或者升级电脑内存: 参考:https://www.omicsclass.com/question/431 

回答于 2018-12-29 21:59

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串联重复基因分析

这个图只绘制了片段复制,结果对的;  串联重复基因有单独分析,你再看看;  串联重复与片段复制之间差别:https://www.omicsclass.com/question/1

回答于 2018-12-29 21:35

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基因家族分析课时20 比较基因组学分析最后一步生成图片时出现这...

空行问题,需要删除:

回答于 2018-12-29 16:55

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get_gene_weizhi.pl 脚本修改

还有输入文件呢》不然我这里也帮不了你; 尽量不要用NCBI上的参考基因组,整理的不好;

回答于 2018-12-29 16:54

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用什么软件可以直接画出染色体Ks值的箱线图?数据格式如下

R语言里面的ggplot可以,具体可以看《ggplot绘图课程》

回答于 2018-12-29 15:41

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Perl脚本的解释

视频里面没讲,是因为对于新手来说,这行代码意义不大;要是细细去讲解对于新手来说又比较深奥,不一定能完全理解; 如果想真正理解,具体可以参考:https://www.omicsclass.com/article/659 理解不了也没有关系,把这一行删除就行; 不影响perl脚本的运行;

回答于 2018-12-29 13:15

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请问在把基因预测中,靶基因与转录因子关系中:tf_cor_target"NA...

问题不清楚,用什么预测的?  NA就是没有靶基因吧

回答于 2018-12-29 11:59

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老师好,我在做课时20 比较基因组学分析时 最后生成的图有9个染...

检查你这9条染色体上基因的位置信息bed文件和cds文件是不是太少,缺了?

回答于 2018-12-28 21:58

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TBtools 的others界面下没有BioSequence Structure Drawers——Ama...

看好TBtools的版本,你的版本太老,你更新一下:https://github.com/CJ-Chen/TBtools/releases 这篇文章中的版本红色方框:https://www.omicsclass.com/article/382

回答于 2018-12-28 21:29