Hisat2-building建立index中的killed问题
学习了有参自主分析之后，使用课程中的方法和脚本，用课程资料的样本数据练习，很流畅，很成功。
随后尝试建立自己的参考基因组（~3.4G）index。尝试了很多次，总是自动killed，生成的ht2文件总是会少1-2个，会生成几个rf文件。
splicesite和exon两个tsv文件都和课程讲解的一致。分析平台是使用服务器（32核+64G内存）搭载的课程资料中的bio-linux虚拟机（分配16核+52G内存）。
请老师指点，谢谢！
最佳答案 2019-02-11 15:22
内存不够，histat 建立索引内存需求很大，你参考基因组3.4G，需要几百G以上的内存。
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