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我的基因组文件很奇怪,转录本不是正常的加个“.1”“.2” 我就全部...

 get_fa_by_id这个脚本,你给他一个ID列表他就可以给你提取出相应的序列;但是ID必须统一才行。

回答于 2019-01-14 14:14

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关于构建进化树的序列问题

你的两个蛋白质文件,不是我们做的转录组,我们不清楚,不能帮你决定取舍; 构建进化树,成员比较分散,不同基因家族分类标准不一样,建议你看看类似文章; 最后,公司分析注释的都是比较简单的功能注释,我们的课程是详细认真的鉴定基因家族基因,所以说:自己手动鉴定的更准确;不然就没有做的必要了;

回答于 2019-01-14 14:12

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想请教下,就是我测了种子五个不同发育时期的转录组,想通过转录...

内参基因都是通用的,稳定表达的基因就可以,可以参考:https://www.omicsclass.com/article/110

回答于 2019-01-14 09:24

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老师好,在基因家族分析课程视频里,鉴定基因家族成员时,里面实...

unigene是转录本序列也就是DNA序列,鉴定基因家族需要用蛋白质序列。 对无参转录组分析结果不了解可以看看我们的课程:《无参转录组结果解读》

回答于 2019-01-14 09:22

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老师你好,我想问下,在做基因家族分析时,我的无参转录本里的un...

公司做的无参转录组结果,UNigene也有对应的蛋白序列,你再在结果里面找找看; 对无参转录组不了解可以看看我们的课程:《无参转录组结果解读》

回答于 2019-01-14 09:21

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老师,我用的拟南芥示例文件,完全按照老师讲解的步骤,但是在新...

可能你的新模型建立有问题,你再检查一下; 

回答于 2019-01-14 09:19

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一个基因家族中的每个基因有多个转录本,如何取舍?

取第一个转录本作为代表序列就可以:https://www.omicsclass.com/question/259/answer/270

回答于 2019-01-14 09:19

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关于pip install RSeQC的安装

这个 错误你得看看搜索一下谷歌,从你提供的信息看不出错误在哪里;

回答于 2019-01-14 09:15

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你好,请问你是做无参转录组基因家族分析吗?我想请问下,你做基...

公司处理的结果,UNigene也有对应的蛋白序列,你再找找看; 或者可以看看我们的课程:《无参转录组结果解读》

回答于 2019-01-14 09:08

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基因家族全基因组文件如何选择?条目太多,不知哪个是教学中讲解...

下载这个几个文件: 基因组这个文件:

回答于 2019-01-11 20:05