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我在文献中读到这么一段话，是关于某一基因家族在某植物各个组织...
提问时，应该附上参考文献链接，你全文阅读都有问题，所以，我这只能推测：作者下载了别人的转录组数据，转录组数据测了不同组织的基因的表达量。不懂转录组可以看视频学习：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读
回答于 2019-03-14 21:44
磷酸转运蛋白家族（PHT1）在Pfam上关键字搜不到pfam 号，在文章...
如何查找基因家族pfam号，参考：https://www.omicsclass.com/question/268 如果发表的文章都没有提到用pfam号，那你的这个家族基因很有可能就没有pfam号；
回答于 2019-03-14 14:23
关于如何确定segmental duplication events
关于基因家族基因串联重复基因和片段复制概念可以参考：https://www.omicsclass.com/question/1 你贴图中如果是用mcscanX分析出的几个，我推测蓝色的连线都是segmental duplication events
回答于 2019-03-14 14:19
基因家族后续实验部分，我看您提到说做转录组绘制热图，再筛选一...
是的，转录组表达定量，说的就是高通量测序数据。如果经费有限，可以使用以前实验室发表过的文章数据，或者使用别人发表的数据也是可以的，这样成本就降低了；
回答于 2019-03-14 14:17
老师，请问一下为什么提取基因在染色体上的位置时，查看gene_chr...
请将运行的脚本，还有所有的输入文件都截图，图文并茂的详细描述问题。不然我这里根据你现有提供的信息无法找到原因； 这个问题和你的挺相似的或许可以帮助你：https://www.omicsclass.com/question/994
回答于 2019-03-12 17:14
基因家族鉴定完后，如何做基因表达？
可以做转录组做基因表达绘制热图，也可以筛选一些家族基因做荧光定量PCR呢，最好两种都做。 具体可以学习：基因家族文献思路解读 实操课程可学习：基因家族分析实操课程、
回答于 2019-03-12 17:11
我在NCBI上下载的CDS数据，在进行提取基因家族的CDS序列时，提取...
提取序列，不知道你用的是哪个脚本？怎么运行的，输入的文件是什么？ 这些都可以截图说明，方便我这里分析原因； 我推测原因： 1.fasta文件，> 后面第一个空格前面的才是序列ID，其他都是序列注释信息，脚本不会读取注释信息； 2.输入的ID列表，要和fasta文件的ID对应一致，才能正确提取成功。
回答于 2019-03-12 17:08
KEGG代谢通路图中的箭头竖线符号等是什么意思？
可以参考KEGG代谢通路详解说明：https://www.omicsclass.com/article/12
回答于 2019-03-11 16:33
老师；请问一下这种图应该通过什么网站；软件经行绘制呢？
蛋白质三维结构展示预测，可以用这个在线软件完成：I-TASSER server 这个我用的不多，你自己看看网站使用说明吧； 参考文献： https://academic.oup.com/nar/article/43/W1/W174/2467872
回答于 2019-03-11 16:18