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4105 个回答

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为什么我按照其他文献中确定的基因下载下来的基因家族,把这些在...

这个得再详细看看文章作者是如何分析的,有可能作者将比对结果中差异大的gap给删除了;

回答于 2019-01-23 09:00

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关于新版BIO-LINUX共线性问题

这里有详细的官方安装说明文档,你可以参考一下:https://github.com/tanghaibao/jcvi 如果安装不成功下载我们的biolinux:https://www.omicsclass.com/article/526

回答于 2019-01-23 08:57

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如何解决meme-v4.12.0软件下载

没有安装meme,请导入我们组学大讲堂百度云盘上biolinux的ova文件,里面我们内置了一些软件,官方原版的biolinux是没有meme软件的; 参考下载安装链接:https://www.omicsclass.com/article/526

回答于 2019-01-22 08:47

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老师,Blastall 报错的问题

当前目录下要提前创建目录:mcscan 才行; linux基础不好,建议学习:《linux系统的使用》 如果想了解perl编程,提高数据分析效率,可学习《perl入门到精通》《perl高级》

回答于 2019-01-22 08:44

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老师,一般在鉴定基因家族成员时,成员最少为多少个就可以做家族...

家族成员太少做分析的话,有些图不好看,但是可以多做几个物种这样就多了,一样可以做的; 可参考这篇文章:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0147651319300089?dgcid=author&tdsourcetag=s_pcqq_aiomsg

回答于 2019-01-20 21:51

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染色体位置

可以用mapchart软件做一个试试:https://www.omicsclass.com/article/397

回答于 2019-01-20 21:46

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clean_result结果是空的

检查分析过程是否正确,如果无误。可能有的基因家族本身就没有复制。

回答于 2019-01-20 21:45

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ORF (bp) ,domain starteend,Sub-cellular localization和No....

orf,No. of introns 可在基因组注释文件GFF里面获得; domain 位置,hmmer搜索的结果里面有; 亚细胞定位有专门的网站工具可以预测,你可以看看文献;

回答于 2019-01-20 21:43

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老师,最近绘制染色体位置的软件都下载不下来了,MapGene2Chrom...

可以用mapchart软件完成染色体定位:https://www.omicsclass.com/article/397 安装包可自行下载;

回答于 2019-01-20 21:41

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关于circos图绘制问题

检查你的links文件,里面是不是有一行位置重复链接到了自己,或者有一行两个基因挨的很近,所以链接又回来了; 然后就出现上面的情况; 基因名字重叠,只显示一个:可以参考这篇文章:https://www.omicsclass.com/article/644 添加设置这个参数:

回答于 2019-01-18 16:13