这里有详细的官方安装说明文档,你可以参考一下:https://github.com/tanghaibao/jcvi 如果安装不成功下载我们的biolinux:https://www.omicsclass.com/article/526
回答于 2019-01-23 08:57
没有安装meme,请导入我们组学大讲堂百度云盘上biolinux的ova文件,里面我们内置了一些软件,官方原版的biolinux是没有meme软件的; 参考下载安装链接:https://www.omicsclass.com/article/526
回答于 2019-01-22 08:47
当前目录下要提前创建目录:mcscan 才行; linux基础不好,建议学习:《linux系统的使用》 如果想了解perl编程,提高数据分析效率,可学习《perl入门到精通》《perl高级》
回答于 2019-01-22 08:44
家族成员太少做分析的话,有些图不好看,但是可以多做几个物种这样就多了,一样可以做的; 可参考这篇文章:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0147651319300089?dgcid=author&tdsourcetag=s_pcqq_aiomsg
回答于 2019-01-20 21:51
orf,No. of introns 可在基因组注释文件GFF里面获得; domain 位置,hmmer搜索的结果里面有; 亚细胞定位有专门的网站工具可以预测,你可以看看文献;
回答于 2019-01-20 21:43
可以用mapchart软件完成染色体定位:https://www.omicsclass.com/article/397 安装包可自行下载;
回答于 2019-01-20 21:41
检查你的links文件,里面是不是有一行位置重复链接到了自己,或者有一行两个基因挨的很近,所以链接又回来了; 然后就出现上面的情况; 基因名字重叠,只显示一个:可以参考这篇文章:https://www.omicsclass.com/article/644 添加设置这个参数:
回答于 2019-01-18 16:13