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4105 个回答

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masurca运行经常出错,有人遇到过类似情况吗

没用过这个软件,不好回答

回答于 2019-02-27 23:42

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老师,我做的是(某)人长链非编码RNA(lncRNA)的基因家族分析,...

人里面很少做基因家族分析,因为分析都很透彻了; 

回答于 2019-02-27 23:42

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有关基因家族鉴定学习课程的问题:在利用hmmer软件鉴定基因家族...

不知道你说的是哪一步操作,可贴图说明; 关于阈值的选取,可以参考文献解读:基因家族文献思路解读

回答于 2019-02-27 23:41

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分析物种间共线性关系报错

看不到文件内容,不好找原因。可以报四个输入文件bed cds , 都head一下截图贴上; 重新更新一下问题;

回答于 2019-02-27 23:38

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绘制转录本结构图通过gffread提取gtf文件transcript_id后名字错...

程序没有出错,读取的是以下ID,你截图的部分gffread不会读取: 尽量不要在NCBI上下载基因组注释信息,后期不好处理;

回答于 2019-02-24 09:24

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老师,我电脑出现这种问题,该怎么解决呢,望老师解惑

这个虚拟机启动的时候提示信息,看看点确认就行;

回答于 2019-02-24 09:20

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老师,我这儿hmmsearch一直都是这个失败,请问是怎么一回事呢?

看看你的当前目录是否有写的权限,估计是权限问题。 挂载共享目录的时候不要选只读挂载。

回答于 2019-02-24 09:19

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片段复制和串联重复

这个是MCScanX给的结果,可参考MCScanX的说明:MCScanX 大片段复制和串联重复见:https://www.omicsclass.com/question/1

回答于 2019-02-18 22:53

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学习中遇见的问题

meme分析搜索motif比较耗时: 看你的截图: 1.输入文件很大,应该是序列很多,可以修改-maxsize 后面的数字,再改大一些; 2.输入的序列很多,meme需要时间运行,请耐心等待。时间太久可以转后台运行。 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家...

回答于 2019-02-18 15:27

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各位老师,请教个问题,二代测序获得的病毒数据库中存在部分细菌...

可以用blast比对NT病毒数据库,比对上的reads进行去除。

回答于 2019-02-18 12:51