没用过qiime去除嵌合体,我们用的是mothur,去除嵌合体,需要很长时间,耐心等待; 嵌合体参考:https://www.omicsclass.com/article/8
回答于 2019-03-25 10:41
我觉得你的fastq2数据是不是弄反了,测序开始的几个碱基抖动很大才对; 质量值高的话不用切掉; 不知道你的数据具体情况,反了是不是错了,问一下你的测序公司吧; fastq文件解读见:二代fastq测序数据解读
回答于 2019-03-22 19:30
E 值越小越好,0说明非常小了,比对结果非常可靠,怎么能说影响结果呢? 具体blast结果说明见:https://www.omicsclass.com/article/505
回答于 2019-03-22 19:28
这里有FPKM的详细定义和计算方法:https://www.omicsclass.com/article/615
回答于 2019-03-21 20:13
基因位置信息 在基因组注释文件gff文件里面找, 染色体长度在基因组fasta序列中计算一下序列长度就有了。 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入...
回答于 2019-03-21 11:20
这个没看到文件没法写脚本: 推荐你学习:perl入门到精通、perl语言高级 课程应该可以自己完成脚本编写 还可学习:linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境、linux命令处理生物大数据、R语言画图、R语言快速入门与提高
回答于 2019-03-21 11:18