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下载拟南芥基因组注释文件老是报错

下载失败吗? 可以参考这里下载拟南芥基因组:https://www.omicsclass.com/article/58

回答于 2019-03-25 10:44

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用qiime识别16S测序结果的嵌合体(chimera)要多久?为什么等好...

没用过qiime去除嵌合体,我们用的是mothur,去除嵌合体,需要很长时间,耐心等待; 嵌合体参考:https://www.omicsclass.com/article/8

回答于 2019-03-25 10:41

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kaks分析复制基因

可以参考一下这篇文章:https://www.omicsclass.com/article/700  看看输出的格式是不是选错了;

回答于 2019-03-23 12:23

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fastq文件前面的预处理

我觉得你的fastq2数据是不是弄反了,测序开始的几个碱基抖动很大才对; 质量值高的话不用切掉; 不知道你的数据具体情况,反了是不是错了,问一下你的测序公司吧; fastq文件解读见:二代fastq测序数据解读

回答于 2019-03-22 19:30

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blast分析重复基因对

E 值越小越好,0说明非常小了,比对结果非常可靠,怎么能说影响结果呢? 具体blast结果说明见:https://www.omicsclass.com/article/505

回答于 2019-03-22 19:28

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请问怎么用RNAseq获得的counts数据,再计算相应的FPRM值呢?求较...

这里有FPKM的详细定义和计算方法:https://www.omicsclass.com/article/615 

回答于 2019-03-21 20:13

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老师我想问一下我没有以下这种情况,就是比如说鉴定的马铃薯基因...

你从哪里鉴定的就用哪里的数据,马铃薯数据库里面应该也有注释基因的CDS,你再找找。

回答于 2019-03-21 20:12

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糖苷水解酶家族1 在茶树染色体的定位图

基因位置信息 在基因组注释文件gff文件里面找, 染色体长度在基因组fasta序列中计算一下序列长度就有了。 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入...

回答于 2019-03-21 11:20

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老师 我在做blast比对时 由于速度太慢 我使用了diamond命令...

这个没看到文件没法写脚本: 推荐你学习:perl入门到精通、perl语言高级  课程应该可以自己完成脚本编写 还可学习:linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境、linux命令处理生物大数据、R语言画图、R语言快速入门与提高

回答于 2019-03-21 11:18

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MCScanX分析中collinearity文件没有结果 其余都有 是什么原因呢

可能 本身就没有共线性,所以是空的

回答于 2019-03-20 23:13