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如何筛选阈值来作为潜在的成员来做第二次的hmm筛选
要进行二次搜索，需要重新建立结构域hmm模型，建议选取可靠完整的结构域建立hmm模型。hmm搜索结果说明见：https://www.omicsclass.com/article/499 基因家族数量，建议看看相关文献；
回答于 2019-04-02 17:40
导入Bio-linux时报错E_FALL(0x80004005) 求老师解答，谢谢
在电脑的BIOS中把CPU的虚拟化打开一下 参考：https://www.omicsclass.com/article/78
回答于 2019-04-01 21:28
如何用hmmer软件中的hmmbuild程序构建MAPK的隐马尔科夫模型（HMM...
基因家族课程里面有这部分课程：学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读
回答于 2019-04-01 10:26
基因串联
1.可以用全基因组的方法，就是MCScanX分析的方法； 2.blast方法，串联重复与大片段复制定义如下： Gene duplications are considered to be one of the primary driving forces in the evolution of genomes and genetic systems [22]. Duplicated genes provide raw material for the generation of new genes, which, i...
回答于 2019-04-01 10:24
blast进行复制基因查找分析
1.可以用全基因组的方法，就是MCScanX分析的方法； 2.blast方法，串联重复与大片段复制定义如下： Gene duplications are considered to be one of the primary driving forces in the evolution of genomes and genetic systems [22]. Duplicated genes provide raw material for the generation of new genes, which, i...
回答于 2019-03-30 23:00
如果计算kaks结果文件里没有ka ks值，但有Divergence-Time得值...
不能直接拿来用，分离时间还需要知道物种进化过程中的突变速率，详情见：https://www.omicsclass.com/question/896
回答于 2019-03-28 13:19
基因启动子序列预测还有没有别的方法？课件里讲到的网站上没有我...
启动子序列预测可以试试，promoter 2.0试试：http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/
回答于 2019-03-28 13:13
linux中无法显示share文件夹
建立共享目录可以参考这里：https://www.omicsclass.com/article/260 linux基础不好建议学习：linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境、linux命令处理生物大数据
回答于 2019-03-26 17:45
TCGAbiolinks包
最新的bioconductor 软件安装已经更新，请参考以下代码安装bioconductor上的TCGAbiolinks包： To install this package, start R (version "3.5") and enter: 确保R版本高于3.5 if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("TCGAbiolinks", versi...
回答于 2019-03-25 10:48