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怎样获取全基因组的蛋白序列

组装之后的基因组,肯定有蛋白质序列和cds序列,你再找找吧。 不然你需要写程序根据gff注释信息从基因组截取cds序列,再翻译出蛋白质;

回答于 2019-03-06 09:06

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MapChart

检查这一行末尾或者中间是不是有空白,把多余的空白删除。

回答于 2019-03-05 09:14

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如何鉴定两个物种的相同基因家族中的具体扩张基因是那几条

关于基因家族基因的扩张与收缩,为比较基因组分析内容,比较复杂,不是简单几句就能解释清楚; 你可以参考这篇文章,借鉴一下方法: https://www.nature.com/articles/ncomms3071

回答于 2019-03-04 17:54

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蛋白结构域完整性的验证

这个看筛选条件了,有的家族进化比较快所以基因之间差异较大,有的家族进化慢,基因之间的保守性高; NCBI的CDD工具更新较快,确认是完整的建议保留;

回答于 2019-03-04 13:20

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请问,TCGA数据库中下载的数据如何区分癌组织和癌旁呢?

可根据样品编号区分不同的类型,具体见:https://www.omicsclass.com/article/439

回答于 2019-03-03 17:59

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请问我该怎么去知道我想做的基因家族分析之前有没有人做过,能给...

简单,查阅文献就行。没有找到相关文献就是别人没做; 

回答于 2019-03-03 17:55

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关于MSCanX画图问题

没测试过蛋白序列,应该是不行,你用cds吧;

回答于 2019-02-28 20:36

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figtree编辑美化进化树的时候bootstrap值怎么是小数呢?

可以用evolview美化编辑进化树可解决这个问题,功能更强大:https://www.omicsclass.com/article/671

回答于 2019-02-28 17:32

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masurca运行经常出错,有人遇到过类似情况吗

没用过这个软件,不好回答

回答于 2019-02-27 23:42

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老师,我做的是(某)人长链非编码RNA(lncRNA)的基因家族分析,...

人里面很少做基因家族分析,因为分析都很透彻了; 

回答于 2019-02-27 23:42