组装之后的基因组,肯定有蛋白质序列和cds序列,你再找找吧。 不然你需要写程序根据gff注释信息从基因组截取cds序列,再翻译出蛋白质;
回答于 2019-03-06 09:06
关于基因家族基因的扩张与收缩,为比较基因组分析内容,比较复杂,不是简单几句就能解释清楚; 你可以参考这篇文章,借鉴一下方法: https://www.nature.com/articles/ncomms3071
回答于 2019-03-04 17:54
这个看筛选条件了,有的家族进化比较快所以基因之间差异较大,有的家族进化慢,基因之间的保守性高; NCBI的CDD工具更新较快,确认是完整的建议保留;
回答于 2019-03-04 13:20
可根据样品编号区分不同的类型,具体见:https://www.omicsclass.com/article/439
回答于 2019-03-03 17:59
可以用evolview美化编辑进化树可解决这个问题,功能更强大:https://www.omicsclass.com/article/671
回答于 2019-02-28 17:32