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KAKS格式转换
看你的命令行输入文件的名字不一样你检查一下： 输入文件有问题，你检查一下；你可以把输入文件和课程里面的文件内容对比一下； 我看不到你的输入文件，不好找原因。
回答于 2020-03-02 19:39
请问在GEO中收到的比如肝癌的随便一篇文章的数据都能拿来分析自...
这个需要查阅文献，看看别人怎么在根据自己的研究目的选择数据的。再有，搜索到的数据要看数据背景信息，处理来源等等； 根据需要选择数据，而不是盲目的选择。最重要的还是多看文献。
回答于 2020-03-02 09:57
老师，我在做hummer搜索时，输入hmmsearch --domtblout ACTS_hmm...
计算机基础知识得补补，科学计数法： 在电脑或计算器中一般用EXP或E（Exponential）来表示10的幂： 7.823E5=7823001.2e−4=0.00012 所以这个值：值最大是3e-10 不是很大，而是很小。
回答于 2020-03-02 09:54
请问 较为小众的物种，其gene symbol的查询
小物种大多是没有 Gene symbol 的，有也是通过同源比对得到注释的Gene symbol。 少数有人详细研究过可能有给出名字；
回答于 2020-02-29 10:59
基因家族分析已经确定是哪个家族之后，找不到pfam号该怎么办？
看看这个如何查找pfam号：https://www.omicsclass.com/question/268 如果找不到，那就是没有了，没有就用blast搜索鉴定基因家族：学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读
回答于 2020-02-29 10:57
老师您好，我想请问一下，通过分析找到的基因家族成员在NCBI上都...
现在除了模式物种，人，小鼠拟南芥等基因组上的基因是经过实验验证的，绝大多数非模式动植物的基因几乎都是计算机预测的基因，有待实验验证研究；预测基因正常的。
回答于 2020-02-29 09:30
R语言分析GEO数据，您好老师，19年参加培训的时候就是用的R3.6.1...
AffyBatch 这个变量前面步骤是否正确生成你需要检查一下； 你看一下 这个包的名字是不是 有错误，记得没有教安装这个包 BiocManager::install("hursta2a520709cdf") 我看你的数据，应该是标准化之后的数据，你直接可以用来做差异分析，不必要用原始数据；你可以绘制box分布图确认一下；https://www.ncbi.nlm.nih.gov...
回答于 2020-02-27 10:45