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$python2 -m jcvi.compara.catalog ortholog ath rapa --cscore=...
看你的文件应该没有问题，再检查一下文件结尾是否有多余的空行，有的话删除试一下； 如果还不行，建议使用我们提供的biolinux 里面安装了python 的mcscan，怀疑你的软件安装问题； https://www.omicsclass.com/article/526 基因家族分析课程：学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读
回答于 2020-03-02 20:02
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老师，你好，安装好Linux系统后，请问提取氨基酸序列的domain_xu...
电脑打开网易云课堂，课程的左下角有参考资料下载，所有的课程都检查一遍都下载下来； 有个打包文件解压之后里面有所有的脚步文件；
回答于 2020-03-02 19:55
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你好，安装好Linux系统后，请问提取氨基酸序列的domain_xulie 的...
电脑打开网易云课堂，课程的左下角有参考资料下载，所有的课程都检查一遍都下载下来； 有个打包文件解压之后里面有所有的脚步文件；
回答于 2020-03-02 19:55
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我运行你在有道笔记中的GEO数据库分析遇到问题？
这个是由于一个基因有多个 entrez ID 导致的： 下面的代码是把多个entreID取了并集，建议取一个作为代表序列；可以提前用Excel处理好基因信息文件表格； DEG_list_kegg <- c()for(i in degs$entrezid){ DEG_list_kegg<-c(DEG_list_kegg,eval(parse(text = i)))}
回答于 2020-03-02 19:53
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如何从已知的基因组里对特定通路上的基因进行筛选鉴定？
这个涉及到基因组序列的批量注释，你可以把基因组上所有基因的序列到kegg数据库里面同源比对一下； 看看哪些基因比对到你感兴趣通路中就找到你想要的基因列表了；
回答于 2020-03-02 19:43
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