5 基因家族分析绘制基因在染色体上的位置gene_chr.txt是空文件

用hmmsearch计算出的id,在进行基因家族分析绘制基因在染色体上的位置gene_chr.txt是空文件,在对gff3做出修改后输出的结果也不对,想请教老师是哪里出了问题,是脚本不对吗?又如何修改呢

输入文件

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以下是过程
attachments-2020-03-vFlBVqWG5e6b0115c33c7.png这个是脚本

attachments-2020-03-jnNR4nbj5e6b014917695.png这个是输出结果为空时用到的GFF3attachments-2020-03-aeMsuTKM5e6c516320ac9.png

在对GFF3做出修改后的结果attachments-2020-03-NROATnCh5e6c52662ff1b.pngattachments-2020-03-UIuBoH0O5e6b0332bfdbc.png


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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

输入文件都要截图,你截图的GFF都是无用的信息;重新更新问题吧;

我猜测你的额GFF文件里面的MRNAID与提供的ID 列表里面的ID不一致,你在看看GFF文件吧;

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