omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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在用tbtools做进化树+motif+结构图，出现这样的错误

三个文件里面的ID修改要一一对应，你再检查一下吧

回答于 2020-05-20 10:44

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blast正常运行结束了吗？中通是不是断了。如果一切正常，那你这个可能就没有共线性；

回答于 2020-05-20 10:43

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把运行的代码贴一下，还有输入文件贴一下，我才好分析原因，你这样我只能猜测了；代码应该没问题，只是输入数据不一样打印的问题把，你继续往下运行吧

回答于 2020-05-20 10:41

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你说的是下面箭头处的两个不知道怎么选吗？我猜是拟南芥相同基因不同的转录本吧，你到GFF基因注释文件里面看看他们的关系就好了，没必要选择，他们是同一个基因； https://www.omicsclass.com/question/2800

回答于 2020-05-19 12:36

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MSTRG开头的基因是组装的新基因，没有基因名字的：转录组数据分析，如果不关心新基因，没必要用stringtie组装，转录组分析课程推荐或者扫码二维码：https://ke.qq.com/course/2555374?saleToken=2130390&from=pclink

回答于 2020-05-19 10:41

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哪里得到的这个脚本？使用我们组学大讲堂提供的biolinux 里面安装的软件：https://www.omicsclass.com/article/526

回答于 2020-05-19 10:40

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看提示没问题的，键盘的方向键是不是按错了，你再按按看：

回答于 2020-05-19 10:37

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cox分析原理及结果阶段见：https://www.omicsclass.com/article/1138

回答于 2020-05-18 12:58

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GSEA富集分析，需要差异表达分析的结果才可以分析。基因的相关性分析，可以用TMM分析；表达为0的基因不影响标准化计算，一般我们不关注表达量很低的基因，一般会过滤一下； TMM之后取对数后续分析，我不知道你后续要分析啥不好回答；

回答于 2020-05-18 12:55

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你的问题是什么？有穿插的样品如果做差异分析的话建议剔除

回答于 2020-05-18 12:50