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如何解决meme-v4.12.0软件下载
使用我们组学大讲堂提供的biolinux，里面又安装好的meme软件：https://www.omicsclass.com/article/526 或者用我们组学大讲堂提供的gene-family docker镜像： 用更好的工具docker：https://ke.qq.com/course/2202806?saleToken=2099432&from=pclink 可解决软件安装问题，以及共享文件夹问题
回答于 2020-06-04 13:59
老师您好，我准备用LInux虚拟机下载Aspera数据 我按照网上的方...
可能网址弄错了吧，或者网络的原因。 我们现在不怎么用biolinux虚拟机，用更好的工具docker； 最近有个数据下载课程，可以看一下：
回答于 2020-06-03 09:41
请问老师们有关基因家族分析有利用较大数量物种（例如50种以上）...
当然可以的，做的多了可以做成数据库，发高分文章，例如这篇转录因子基因家族分析，很多家族很多物种，发表在NAR上：http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn/index.php
回答于 2020-06-02 15:56
请问老师们有关基因家族分析有利用较大数量物种（例如50种以上）...
当然可以的，做的多了可以做成数据库，发高分文章，例如这篇转录因子基因家族分析，很多家族很多物种，发表在NAR上：http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn/index.php
回答于 2020-06-02 15:53
老师您好，我在做物种间基因组共线性分析时没有得到.anchors文件...
文件格式有问题吧，你的bed文件才14行，有问题吧 如果基因这么少，没必要用mcscan比较基因组分析了；做个blast就好了
回答于 2020-06-01 11:34
RNA-seq分析，用index.sh建立索引exons.tsv文件为空
刚刚看你的问题，你的GFF文件不是标准的GFF文件，第三列没有gene标识， 建议添加gene行，可参考这里修改：https://www.omicsclass.com/article/816 提示：看你做的物种为棉花，由于棉花基因组较大，会消耗大量的内存，自己的笔记本建立该物种索引可能由于内存限制可能会建立不成功，可联系我们帮你建立；
回答于 2020-06-01 11:31