可到perl官方网站下载,根据自己的操作系统选择对应的版本:https://www.perl.org/get.html
回答于 2020-06-01 11:24
只有VCF文件不行,你需要计算SNP-index才行,然后再分析绘图,可参考这种:https://github.com/bmansfeld/QTLseqr
回答于 2020-06-01 10:29
是用一代sanger测序得到的基因序列吗? 如果是,那你用mega比对完之后,可以适当删除一些不保守的区域:https://www.omicsclass.com/question/832 两个基因放在一起构建进化树,建议你先单独分别多序列比对,再合并:直接链接成super基因就可以;
回答于 2020-05-28 17:39
GEO数据的下载与表达量,你需要学习一下R语言,可以分析数据:GEO芯片数据挖掘、 GEO芯片数据不同平台标准化
回答于 2020-05-28 09:44
sra数据NCBI提供工具sratoolkit可以转换:https://www.omicsclass.com/article/932 我们近期有课程,你可以关注公众号有通知:
回答于 2020-05-28 09:37
GFF里面有外显子的信息,你看懂了GFF文件,再学习一下perl或者python就可以完成: 生物信息入门到精通必修基础课:linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境、实验室linux生信分析平台搭建、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到精通
回答于 2020-05-26 13:15
可能是软件安装的问题吧,转录组如果不关注新基因,没必要做转录本组装, 建议学习docker 软件安装问题很好解决:用更好的工具docker:https://ke.qq.com/course/2202806?saleToken=2099432&from=pclink 学习转录组数据分析课程:二代测序转录组数据自主分析、
回答于 2020-05-26 13:11