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4095 个回答

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perl老师你好!可以发一下perl的安装包么?在网上下载一直下不下...

可到perl官方网站下载,根据自己的操作系统选择对应的版本:https://www.perl.org/get.html

回答于 2020-06-01 11:24

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黄老师,我已获得BSA流程过滤后的snp的vcf文件,然后怎么利用这...

只有VCF文件不行,你需要计算SNP-index才行,然后再分析绘图,可参考这种:https://github.com/bmansfeld/QTLseqr

回答于 2020-06-01 10:29

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测序公司返回的DNA序列,在序列比对时是不是要删除首尾的一些序...

是用一代sanger测序得到的基因序列吗? 如果是,那你用mega比对完之后,可以适当删除一些不保守的区域:https://www.omicsclass.com/question/832 两个基因放在一起构建进化树,建议你先单独分别多序列比对,再合并:直接链接成super基因就可以;

回答于 2020-05-28 17:39

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老师您好,请问怎么从GEO中几万个基因数据中找出几千个想要的基...

GEO数据的下载与表达量,你需要学习一下R语言,可以分析数据:GEO芯片数据挖掘、 GEO芯片数据不同平台标准化 

回答于 2020-05-28 09:44

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sra文件转换为fastq文件

sra数据NCBI提供工具sratoolkit可以转换:https://www.omicsclass.com/article/932 我们近期有课程,你可以关注公众号有通知:

回答于 2020-05-28 09:37

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gff文件包含gene,cds,exon,mRNA的信息,请问如何获取intron的位...

GFF里面有外显子的信息,你看懂了GFF文件,再学习一下perl或者python就可以完成: 生物信息入门到精通必修基础课:linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境、实验室linux生信分析平台搭建、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到精通

回答于 2020-05-26 13:15

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老师您好,我在做基因结构分析时,只得到mRNA和CDS的信息,请问...

这个地方改成exon试试:

回答于 2020-05-26 13:13

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我在用snpeff进行snp注释的时候,发现出现如下错误java.lang.Run...

没用过snpEFF,我们都用ANNOVAR注释基因组;

回答于 2020-05-26 13:12

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stringtie报错

可能是软件安装的问题吧,转录组如果不关注新基因,没必要做转录本组装, 建议学习docker 软件安装问题很好解决:用更好的工具docker:https://ke.qq.com/course/2202806?saleToken=2099432&from=pclink   学习转录组数据分析课程:二代测序转录组数据自主分析、

回答于 2020-05-26 13:11

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请问老师多基因组同心圆图怎么做?

可以用circos绘图,你的问题挺复杂的,图后面的数据分析你也需要做才行

回答于 2020-05-26 13:09